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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G001154

染色体: Chr06 坐标: 11682267-11683487 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G001154
名称SmilChr06G001154
描述probable carbohydrate esterase At4g34215
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向11682267 - 11683487 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130988673
GeneID130988673
locus_tag-
NCBI NameLOC130988673
原始查询SmilChr06G001154

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述probable carbohydrate esterase At4g34215
产物probable carbohydrate esterase At4g34215
ArabidopsisAT3G53010 (AT3G53010)
carbohydrate esterase, putative (DUF303) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824467]
identity=46.3; qcov=0.932; evalue=4.76e-71; confidence=high
RiceOs04g0276600
-
identity=48.5; qcov=0.913; evalue=1.02e-70; confidence=high
GO-
KEGG-
PfamPF03629 (SASA)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130988673

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Secreted 分泌到胞外 1.00000 XP_057768563.1
2 Vacuole 液泡 0.20000 XP_057768563.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057768563.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057768563.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057768563.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768563.1
264 aa
N
1
132
264
SASA
C
PF03629 SASA 23-260 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057768563.1 Pfam PF03629 SASA Domain 23 260 1.5e-75 254.4 Carbohydrate esterase, sialic acid-specific acetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057912580.1
GAATGAACCAAATCGCAACTTAATAAGAGTCCAAGTCCAACTCATTGTCTCAAATGATCAAATCCAGTATTCAATTCTCTATATATAGGCTTTAATAGATAGATAATTTGCAGCCTCACTCTCTCTTTTACGTATTCATCTATTCTCTTGTCTCTCTCTCTCTCTTAAATCAAACGCACATCCTTTGGAAAACAAGCAGCGCAACCATGGCACTGATGATATTCTTCCTTGTAGCCTTCTTCCTTAGGGCTTCCTCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130988673
ATGGCACTGATGATATTCTTCCTTGTAGCCTTCTTCCTTAGGGCTTCCTCTTCCTCAGCCTGTGACAAAGCAATATTCTTGCTGGCGGGGCAAAGCAATATGGCTGGCCGGGGTGGCATTTTCCATAATAAATGGGACGGATACACTCCTCCCCTCTGCCGAGCCAGTCCACGGATCCTCCGTCTCAACAACCAGACGGCATGGGAGGAGGCTCGTGAGCCTCTACACGGAAACATCTCCTTTGCGCCTTGCCCGGGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057768563.1
MALMIFFLVAFFLRASSSSACDKAIFLLAGQSNMAGRGGIFHNKWDGYTPPLCRASPRILRLNNQTAWEEAREPLHGNISFAPCPGSNAPAGIGPGMAFANTLLKRDPTIGTIGLVPCAVGMTGISDWRRGSCLYARLMSRARAALREGGALRGMLWYQGENDINVSTAGMYEDRLRTFFNDVRNDLSSPSLPIIQVALASPNISTNSGTRKIRSIQLHLKLPNLMCVDAKGLAVDDYQKLHLTTDAQVKLGSKMAHAFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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