当前解析结果
SmilChr06G001157| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001157 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001157 |
| 描述 | probable carbohydrate esterase At4g34215 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 11751653 - 11752870 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988677 |
|---|---|
| GeneID | 130988677 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988677 |
| 原始查询 | SmilChr06G001157 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable carbohydrate esterase At4g34215 |
| 产物 | probable carbohydrate esterase At4g34215 |
| Arabidopsis | AT3G53010 (AT3G53010)carbohydrate esterase, putative (DUF303) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824467] identity=46.3; qcov=0.932; evalue=4.76e-71; confidence=high |
| Rice | Os04g0276600- identity=48.5; qcov=0.913; evalue=1.02e-70; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03629 (SASA) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988677 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057768567.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057768567.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057768567.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768567.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768567.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057768567.1PF03629
SASA 23-260 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057768567.1 |
Pfam | PF03629 |
SASA | Domain | 23 | 260 | 1.5e-75 | 254.4 | Carbohydrate esterase, sialic acid-specific acetylesterase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。