当前解析结果
SmilChr06G001165| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001165 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001165 |
| 描述 | ENHANCER OF AG-4 protein 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 11868929 - 11871689 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988685 |
|---|---|
| GeneID | 130988685 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988685 |
| 原始查询 | SmilChr06G001165 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ENHANCER OF AG-4 protein 2-like |
| 产物 | ENHANCER OF AG-4 protein 2-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988685 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057768576.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057768576.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768576.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768576.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057768576.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:11869692 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,B131 |
Chr6:11869697 |
GAT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 10 | A21,B20,B32,B35,B47,B5,B62,B73,C62,C75 |
Chr6:11869700 |
T |
TCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 10 | A21,B20,B32,B35,B47,B5,B62,B73,C62,C75 |
Chr6:11869702 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B103,B128,B138,B99,C37 |
Chr6:11870452 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,B13 |
Chr6:11870457 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B78,C85 |
Chr6:11870463 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B80,B99,C30,C75 |
Chr6:11870466 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr6:11870487 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B80,B99,C30,C75 |
Chr6:11870698 |
AGC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 9 | B113,B122,B132,B26,B28,B68,C39,C42,C85 |
Chr6:11870713 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B104 |
Chr6:11870713 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。