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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001168`

染色体: Chr06 坐标: 11905242-11907813 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001168`
名称	SmilChr06G001168
描述	DNA-directed RNA polymerases II and V subunit 8A-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	11905242 - 11907813 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988689`
GeneID	`130988689`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988689`
原始查询	`SmilChr06G001168`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerases II and V subunit 8A-like
产物	DNA-directed RNA polymerases II and V subunit 8A-like
Arabidopsis	`AT1G54250` (NRPB8A) RNA polymerase Rpb8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841866] identity=64.5; qcov=0.638; evalue=1.4e-65; confidence=high
Rice	`Os03g0845700` (OSJNBa0032G11.30) - identity=64.9; qcov=0.67; evalue=2.05e-65; confidence=high
GO	GO:0003899 (DNA-directed RNA polymerase activity); GO:0005665 (RNA polymerase II, core complex); GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0005736 (RNA polymerase I complex); GO:0006351 (DNA-templated transcription)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03870 (RNA_pol_Rpb8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988689

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768586.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057768586.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768586.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768586.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768586.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:11905259`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	B11,B123,B26,B35,B41,B44,B64,B65,B73,B80,B89,B99,C3,C30,C40,C43,C51,C6,C75,C77,C87
`Chr6:11905285`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B103,B16,B47,B85,B94,C13,C35,C59,C64,C66,C81,D1
`Chr6:11905315`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	57	A10,A14,A15,A16,A20,A21,A22,A7,B104,B111,B112,B118,B119,B12,B128,B136,B140,B15,B23,B27,B28,B3,B30,B36,B4,B42,B43,B54,B57,B67,B71,B72,B75,B81,B82,B9,B90,B92,C17,C19,C33,C38,C42,C61,C63,C64,C66,C73,C79,C81,C83,C86,D1,D10,D11,D5,D7
`Chr6:11905320`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	B104,B11,B123,B26,B35,B41,B44,B57,B64,B65,B73,B80,B89,B99,C3,C30,C40,C43,C51,C6,C74,C75,C77,C87,D4
`Chr6:11905323`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B137,B139,C4,C48
`Chr6:11905323`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B137,B139,C4,C48
`Chr6:11905334`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B24,C8
`Chr6:11905334`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B24,C8
`Chr6:11905346`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	B104,B11,B26,B35,B41,B44,B57,B64,B65,B73,B80,B89,B99,C3,C30,C40,C43,C51,C6,C74,C75,C77,C87,D4
`Chr6:11905360`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B103,B16,B47,B85,B94,C13,C35,C59,C60,C64,C66,C81,D1
`Chr6:11905388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,B70,B71,C62
`Chr6:11906553`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A22,B118,B54,B67,B71,B82,C61,C63,C81,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768586.1

221 aa

110

221

RNA_pol_Rpb8

PF03870 RNA_pol_Rpb8 83-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768586.1`	Pfam	`PF03870`	RNA_pol_Rpb8	Family	83	220	8.8e-52	175.7	RNA polymerase Rpb8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912603.1
TATGAGAAGCCCAATTTCTATTTATTTAGGGCCCATATTTGATATTAAGCAAGGCCCAACTCTCTTGTTCTTTTTCTCTCACTGTGTGCAACCAAACTCATCTTTCTTCTTCAATTTCCGGCCGACCGCCGCCTATCGCATCTCGCCGTCCTCGTTACGCGGCCACCTCTCGCCGTTTGCGCGTCTCCATCCATCCGACATATTCAGCTTCTTCTTGGGTGTAGTAAAGATGGTGGAGACGCTTTTTGAAGATATATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988689
ATGAGAAGCCCAATTTCTATTTATTTAGGGCCCATATTTGATATTAAGCAAGGCCCAACTCTCTTGTTCTTTTTCTCTCACTGTGTGCAACCAAACTCATCTTTCTTCTTCAATTTCCGGCCGACCGCCGCCTATCGCATCTCGCCGTCCTCGTTACGCGGCCACCTCTCGCCGTTTGCGCGTCTCCATCCATCCGACATATTCAGCTTCTTCTTGGGTGTAGTAAAGATGGTGGAGACGCTTTTTGAAGATATATTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768586.1
MRSPISIYLGPIFDIKQGPTLLFFFSHCVQPNSSFFFNFRPTAAYRISPSSLRGHLSPFARLHPSDIFSFFLGVVKMVETLFEDIFRIDAIDPDGKKFDRVSRISARSEQFDMLMHLDVNTEIYPMRAGEKFMMVLASTLNLDGTPDSGYYTPGNKKSLADKFDYVMQGKLYRISEESREKQVKADIYVSFGGLLMMLKGDPSIAARFELDQKLFILIRKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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