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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001174`

染色体: Chr06 坐标: 11951947-11952390 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001174`
名称	SmilChr06G001174
描述	cold-responsive protein kinase 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	11951947 - 11952390 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990496`
GeneID	`130990496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990496`
原始查询	`SmilChr06G001174`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cold-responsive protein kinase 1-like
产物	cold-responsive protein kinase 1-like
Arabidopsis	`AT1G16670` (AT1G16670) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838236] identity=63.8; qcov=0.959; evalue=5.22e-55; confidence=high
Rice	`Os02g0165100` (OsRLCK63) - identity=65.8; qcov=0.776; evalue=4.86e-47; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057770706.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770706.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770706.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770706.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770706.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:11952101`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B56,C10,C22,C70,C75
`Chr6:11952101`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B56,C10,C22,C70,C75
`Chr6:11952104`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B74
`Chr6:11952104`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B74
`Chr6:11952132`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B28,C10,C2,C32,C68,C70,C75
`Chr6:11952144`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	C10,C70,C75
`Chr6:11952144`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	C10,C70,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770706.1

147 aa

147

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 46-129 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 46-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770706.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	46	129	2.5e-14	54.1	Protein kinase domain
`XP_057770706.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	46	129	3.6e-16	60.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914723.1
ATGACCTGTCTATCATTCTTATGTGGACAAAATTCAGCAACAGGCGATCCAGAGCTTGGGGATGAGCTCTCAGGACTGCAAAATGTTATTCTATACTCATACAAGGAGTTGGCAATTGCAACCAATGATTTTAGTCTAGCGAATAAAATTGGGGAGGGAGGATTTGGTTCCGTCTATAAGGGAAAACTTAAGAATGGGCAGATGGCTGCAATTAAGGTTCTCTCTGCTGAATCGAGACAAGGAGTGAGAGAGTTCTTGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990496
ATGACCTGTCTATCATTCTTATGTGGACAAAATTCAGCAACAGGCGATCCAGAGCTTGGGGATGAGCTCTCAGGACTGCAAAATGTTATTCTATACTCATACAAGGAGTTGGCAATTGCAACCAATGATTTTAGTCTAGCGAATAAAATTGGGGAGGGAGGATTTGGTTCCGTCTATAAGGGAAAACTTAAGAATGGGCAGATGGCTGCAATTAAGGTTCTCTCTGCTGAATCGAGACAAGGAGTGAGAGAGTTCTTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770706.1
MTCLSFLCGQNSATGDPELGDELSGLQNVILYSYKELAIATNDFSLANKIGEGGFGSVYKGKLKNGQMAAIKVLSAESRQGVREFLTEIQVISDIEHENLVKLYGCCVERNQRNSIYNYLENNSLAKTLLGGGYWVCSIHFKTNPLI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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