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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001177`

染色体: Chr06 坐标: 11973393-11978900 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001177`
名称	SmilChr06G001177
描述	uncharacterized SmilChr06G001177
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	11973393 - 11978900 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988697`
GeneID	`130988697`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988697`
原始查询	`SmilChr06G001177`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0004721 (phosphoprotein phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03031 (NIF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988697

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768595.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057768600.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057768600.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768595.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768595.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:11974317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B32,B91,C86
`Chr6:11974775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr6:11974854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B134,B32,B91,C86
`Chr6:11974871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B9,C38
`Chr6:11974917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C42
`Chr6:11975133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C8
`Chr6:11975512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B26,B9,C38,C42
`Chr6:11975629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C8
`Chr6:11975666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B96,C42
`Chr6:11975673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:11975767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr6:11975774`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768595.1

934 aa

467

934

NIF

PF03031 NIF 710-892 aa

XP_057768596.1

934 aa

467

934

NIF

PF03031 NIF 710-892 aa

XP_057768598.1

934 aa

467

934

NIF

PF03031 NIF 710-892 aa

XP_057768599.1

934 aa

467

934

NIF

PF03031 NIF 710-892 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768595.1`	Pfam	`PF03031`	NIF	Family	710	892	7.1e-19	68.8	NLI interacting factor-like phosphatase
`XP_057768596.1`	Pfam	`PF03031`	NIF	Family	710	892	7.1e-19	68.8	NLI interacting factor-like phosphatase
`XP_057768598.1`	Pfam	`PF03031`	NIF	Family	710	892	7.1e-19	68.8	NLI interacting factor-like phosphatase
`XP_057768599.1`	Pfam	`PF03031`	NIF	Family	710	892	7.1e-19	68.8	NLI interacting factor-like phosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

8 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090173.1
GTGGGGGGTTAGTTTTGTTTTTAAAAAGTTACCCTTTCTTTTCTGCGTACCTTCCTTCCTCTCCTCTCCTCCCTTTCCCTCTCTTCCCTTTTCTCTTCTGCCTCACACAGCCATTGCCAAAGGGCGACTCAGGAAACCTCCGCCCCTCACCATCGCCTTCTACTTCTTCTCCGCCCGCTGCTTCAGCCATAAACAATTGCCACCGCCCGTTCAATTTGCCGCCGATTTTCCCTTTCAGCTCTGATATGATTGACACAAGC...

XR_009090175.1
GTGGGGGGTTAGTTTTGTTTTTAAAAAGTTACCCTTTCTTTTCTGCGTACCTTCCTTCCTCTCCTCTCCTCCCTTTCCCTCTCTTCCCTTTTCTCTTCTGCCTCACACAGCCATTGCCAAAGGGCGACTCAGGAAACCTCCGCCCCTCACCATCGCCTTCTACTTCTTCTCCGCCCGCTGCTTCAGCCATAAACAATTGCCACCGCCCGTTCAATTTGCCGCCGATTTTCCCTTTCAGCTCTGATATGATTGACACAAGC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC130988697
ATGGATACACTTTCAACAGAAATTCTCTGTGGTGAGAAAGCTAACGGGAGAAAAAATAAGACCCGAAAGAGCAAGAAGGCAAGAGTTAAAGATGAAGGCCGGAGCTTGGACCAGAATAACATAGATACTCAATTAATAAAGCACAGTACTGAAGGAAATGTGTTTGTGGACAAGCTGATTAAAGATGAAGTCCAAAGTGCGGGTCAAACTAAAATAGTTACAAGGTCAATGAAAAAACTTGCTGAAAGAAATGCAACTAT...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057768595.1
MDTLSTEILCGEKANGRKNKTRKSKKARVKDEGRSLDQNNIDTQLIKHSTEGNVFVDKLIKDEVQSAGQTKIVTRSMKKLAERNATIEKPKDKDEHEFFCQRRADTGSSANLSEVSVATENPVLLDEYQSNIDTGPTKSIAEGTVTGKRTEKRKRTARGEIDSAQCKPNCRNLAEENLTTKKSKIKDEVQKTGPTEMDIGNLKLQDETQSMCHTDLDNAQAQSVVTKRKTKKKANVTNEKPIVKDELRTLGQIQMHTGST...

XP_057768596.1
MDTLSTEILCGEKANGRKNKTRKSKKARVKDEGRSLDQNNIDTQLIKHSTEGNVFVDKLIKDEVQSAGQTKIVTRSMKKLAERNATIEKPKDKDEHEFFCQRRADTGSSANLSEVSVATENPVLLDEYQSNIDTGPTKSIAEGTVTGKRTEKRKRTARGEIDSAQCKPNCRNLAEENLTTKKSKIKDEVQKTGPTEMDIGNLKLQDETQSMCHTDLDNAQAQSVVTKRKTKKKANVTNEKPIVKDELRTLGQIQMHTGST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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