当前解析结果
SmilChr06G001182| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001182 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001182 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001182 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 12014431 - 12017047 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990499 |
|---|---|
| GeneID | 130990499 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990499 |
| 原始查询 | SmilChr06G001182 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990499 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770710.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057770710.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770710.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770710.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770710.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:12014587 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 42 | A14,A15,A16,A21,A24,A7,B108,B110,B111,B112,B118,B12,B128,B13,B140,B15,B18,B28,B3,B30,B42,B43,B54,B57,B67,B71,B82,B90,B92,C19,C33,C46,C52,C61,C64,C66,C74,C81,C83,C86,D5,D7 |
Chr6:12014594 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr6:12014620 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,C42 |
Chr6:12014682 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B113,B32,B91,C86 |
Chr6:12014687 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A14,D1 |
Chr6:12014687 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | A14,D1 |
Chr6:12014724 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B134 |
Chr6:12014744 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B74,C18,C70 |
Chr6:12014785 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B15,B91 |
Chr6:12014788 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B78,C85 |
Chr6:12014803 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C68 |
Chr6:12014807 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C2,C68 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。