当前解析结果
SmilChr06G001190| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001190 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001190 |
| 描述 | rop guanine nucleotide exchange factor 7-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 12117309 - 12118251 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988708 |
|---|---|
| GeneID | 130988708 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988708 |
| 原始查询 | SmilChr06G001190 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | rop guanine nucleotide exchange factor 7-like |
| 产物 | rop guanine nucleotide exchange factor 7-like |
| Arabidopsis | AT5G02010 (ROPGEF7)RHO guanyl-nucleotide exchange factor 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831858] identity=74.4; qcov=1; evalue=1.53e-34; confidence=medium |
| Rice | Os01g0849100 (OsRacGEF1)- identity=72; qcov=1; evalue=2.72e-34; confidence=medium |
| GO | GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03759 (PRONE) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988708 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057768614.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057768614.1 |
| 3 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057768614.1 |
| 4 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057768614.1 |
| 5 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057768614.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057768614.1PF03759
PRONE 1-81 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057768614.1 |
Pfam | PF03759 |
PRONE | Family | 1 | 81 | 9e-36 | 124.2 | PRONE (Plant-specific Rop nucleotide exchanger) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。