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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001196`

染色体: Chr06 坐标: 12234292-12238597 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001196`
名称	SmilChr06G001196
描述	alpha/beta hydrolase domain-containing protein VTE7-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12234292 - 12238597 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988713`
GeneID	`130988713`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988713`
原始查询	`SmilChr06G001196`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta hydrolase domain-containing protein VTE7-like
产物	alpha/beta hydrolase domain-containing protein VTE7-like
Arabidopsis	`AT1G13820` (AT1G13820) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837943] identity=64.5; qcov=0.851; evalue=4.82e-144; confidence=high
Rice	`Os02g0705100` - identity=30.9; qcov=0.391; evalue=1.95e-09; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988713

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057768625.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057768625.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057768625.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12234502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr6:12234503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:12234529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:12234649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr6:12235579`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C61
`Chr6:12235579`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768625.1

348 aa

174

348

Abhydrolase_1

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 84-184 aa PF12146 Hydrolase_4 86-315 aa PF12697 Abhydrolase_6 86-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768625.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	84	184	1.9e-18	67.7	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057768625.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	86	315	3.9e-13	50.0	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057768625.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	86	320	2e-13	52.2	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912642.1
CATTTTTTTTGTTTCACTATTCTTAATAATTCCCGGAATTCATTTCAGTTAGGAAATATCTGTTTTCGTACATTTCTTGCATTTATGTTGCGAAGAAAGTAGTACAATTTTTCCTATAGTATCTGAGATTATCACTTTTGTTGCATAACTTTCTTGACTTTAAGAGAGGGATCACGCCGGTGTTTTGGACAAAAATGGCAGTATCTCTGGCATTTCCGCTCCAGCAATGTGGTCCAAGAAAGTCACCTCCTTTCAGAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988713
ATGGCAGTATCTCTGGCATTTCCGCTCCAGCAATGTGGTCCAAGAAAGTCACCTCCTTTCAGAGTTTCCGGCAGTGGCGGTGGCGACGGTGGGGTGTTCCCATCTTTTCTGCCGGAGGAGGTTAACAAAATCAGAGACCCTTTTGCTAGAACTTTGGCCCAGAGGATAGAAAGGCTTCCAGTGCAGGTTGGATTTTCTGAGAGTAGCATAATGAGTAGCTGTGTAATGCCAAGAATCCGGGGTGATTCCAATCCAGTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768625.1
MAVSLAFPLQQCGPRKSPPFRVSGSGGGDGGVFPSFLPEEVNKIRDPFARTLAQRIERLPVQVGFSESSIMSSCVMPRIRGDSNPVVLLHCFDSSCLEWRSAYPLLEDAGLEVWAIDVLGWGFSDLEGRPPCNVASKRYHLYQLWKSHIKRPMTLVGPSLGAAVAIDFAVNFPEAVKELILINANVYANGTGVLTKLPKSAAYAMASLLKSTPIRWYAKLLVFNGISLSSVLDYTNVGRLHCLLPWWEDATVNFMLSGGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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