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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001205`

染色体: Chr06 坐标: 12322307-12332545 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001205`
名称	SmilChr06G001205
描述	histone deacetylase HDT1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12322307 - 12332545 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990501`
GeneID	`130990501`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990501`
原始查询	`SmilChr06G001205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase HDT1-like
产物	histone deacetylase HDT1-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990501

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057770712.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770712.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057770712.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770712.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770712.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12322329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B139,B32,C4,C48
`Chr6:12322341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:12322368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B110,B13,C52
`Chr6:12323215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B1,B26,B80,B99,C30,C75
`Chr6:12323216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B10,C76
`Chr6:12323216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C76
`Chr6:12323232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr6:12323325`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A16,A21,A24,A7,B111,B112,B13,B23,B28,B3,B33,B42,B43,B49,B55,B61,B70,B74,B79,B85,B94,B95,C12,C16,C33,C45,C52,C58,C64,C66,C78,C83,D3,D5
`Chr6:12323334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	66	A15,A19,A2,A23,A4,B1,B119,B127,B131,B135,B14,B18,B2,B23,B26,B27,B34,B37,B38,B40,B44,B48,B51,B52,B58,B65,B66,B7,B75,B76,B78,B79,B87,B9,B96,B98,C1,C14,C15,C16,C18,C2,C32,C34,C37,C38,C40,C46,C49,C5,C53,C54,C55,C68,C71,C73,C75,C77,C8,C80,C84,C85,D2,D4,D6,D9
`Chr6:12323954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:12323980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:12328944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C87,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914729.1
ATGTCTGAGAACACAAGAGTTACTCATGTAAATAGAAAAACAAGAGCAAGTGCAAGTGCAAGTGGTGAAGCTATAGGAGTTCTTAAGGCAATTTCATGGATTAAGGAGAAAGTTTTCAGTATTTTGAAGATATTTCTTCTATGGGCTTATCTCATTGAGGAGAAAAAGAAGAATAGAGACAAATCTGTTAGCTTGTTTGTGAATGTTGATGGGAAGAAATTTGCTCATGCAACACTATTCTCTAAGAAGTTTCCCCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990501
ATGTCTGAGAACACAAGAGTTACTCATGTAAATAGAAAAACAAGAGCAAGTGCAAGTGCAAGTGGTGAAGCTATAGGAGTTCTTAAGGCAATTTCATGGATTAAGGAGAAAGTTTTCAGTATTTTGAAGATATTTCTTCTATGGGCTTATCTCATTGAGGAGAAAAAGAAGAATAGAGACAAATCTGTTAGCTTGTTTGTGAATGTTGATGGGAAGAAATTTGCTCATGCAACACTATTCTCTAAGAAGTTTCCCCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770712.1
MSENTRVTHVNRKTRASASASGEAIGVLKAISWIKEKVFSILKIFLLWAYLIEEKKKNRDKSVSLFVNVDGKKFAHATLFSKKFPQQQFKNVDDDDSNSDAGKKEVKIVEPNSLDDYDGMSVDDSEILISSQEVKIVEPSSVDDYDGMFVDDSERKRPYKAKVGTLFEELCSREPGDKMSRTATNVPVEAQGEAITPPPDDEDVASKETRIGKKTLCGLAALHPIYG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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