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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001211`

染色体: Chr06 坐标: 12404931-12413278 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001211`
名称	SmilChr06G001211
描述	nuclear transport factor 2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12404931 - 12413278 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988727`
GeneID	`130988727`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988727`
原始查询	`SmilChr06G001211`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transport factor 2-like
产物	nuclear transport factor 2-like
Arabidopsis	`AT5G60980` (AT5G60980) Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein with RNA binding (RRM-RBD-RNP motifs) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836219] identity=48.4; qcov=0.989; evalue=8.9e-105; confidence=high
Rice	`Os03g0418800` - identity=40.3; qcov=1.07; evalue=2.8e-98; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF02136 (NTF2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988727

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768643.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057768643.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057768644.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057768643.1`
5	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057768643.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12407185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr6:12407974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:12408051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B51
`Chr6:12408229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:12408239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr6:12412140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr6:12412922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B99,C30,C75
`Chr6:12413067`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A13,A16,A5,A8,A9,B104,B107,B120,B136,B137,B138,B139,B19,B32,B45,B49,B5,B59,B60,B7,C26,C35,C36,C43,C45,C46,C48,C53,C78,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768643.1

522 aa

261

522

NTF2

RRM_1

PF02136 NTF2 79-195 aa PF00076 RRM_1 368-426 aa

XP_057768644.1

460 aa

230

460

NTF2

RRM_1

PF02136 NTF2 17-133 aa PF00076 RRM_1 306-364 aa

XP_057768645.1

460 aa

230

460

NTF2

RRM_1

PF02136 NTF2 17-133 aa PF00076 RRM_1 306-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768643.1`	Pfam	`PF02136`	NTF2	Domain	79	195	2.1e-34	119.2	Nuclear transport factor 2 (NTF2) domain
`XP_057768643.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	368	426	1.5e-10	41.5	RNA recognition motif
`XP_057768644.1`	Pfam	`PF02136`	NTF2	Domain	17	133	1.7e-34	119.5	Nuclear transport factor 2 (NTF2) domain
`XP_057768644.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	306	364	1.3e-10	41.7	RNA recognition motif
`XP_057768645.1`	Pfam	`PF02136`	NTF2	Domain	17	133	1.7e-34	119.5	Nuclear transport factor 2 (NTF2) domain
`XP_057768645.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	306	364	1.3e-10	41.7	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912660.1
GGAGCAGAACTTTTGTTCTAAATTTCGAAGAAATGGTTAATGAATCTCTCGTGGAATATACACATCCATCCGCTCTCAACTTAATAAATAAATTTCAAAAAAAAAAAAAAACACACTAAATAAAAATAAAGGTTTTAAAAGAAAAGAAAAACTAAAAATAAAAATACAAATCCCTCTCTCTCTCTCGTTTTATTTTATGGAGTATAATTATATTCAAAGACTTGAATCTCTTTTCACTCTCACTTGGTCTCTCTGTGTCC...

XM_057912661.1
AATTATATTCAAAGACTTGAATCTCTTTTCACTCTCACTTGGTCTCTCTGTGTCCTCGTCGCCAATTCTCACTCGTCTCTCCAAAATTCGCTTGTCATCTCCTTCTCGTCATACTCATTTTCTCCGCATTCGTATCTGTCCTTCTCTACTCCGCAAATCAAGTGCCTTCAATCAGCCCTCCTTAGGAATGGCCACGCAAACTGAGAGTCCTCCTCCAGCTCCGAGTGCTCAAGTGATTGGAAATGCTTTTGTTGAGCAGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130988727
ATGGAGTATAATTATATTCAAAGACTTGAATCTCTTTTCACTCTCACTTGGTCTCTCTGTGTCCTCGTCGCCAATTCTCACTCGTCTCTCCAAAATTCGCTTGTCATCTCCTTCTCGTCATACTCATTTTCTCCGCATTCGTATCTGTCCTTCTCTACTCCGCAAATCAAGTGCCTTCAATCAGGAATGGCCACGCAAACTGAGAGTCCTCCTCCAGCTCCGAGTGCTCAAGTGATTGGAAATGCTTTTGTTGAGCAGTA...

LOC130988727
ATGGCCACGCAAACTGAGAGTCCTCCTCCAGCTCCGAGTGCTCAAGTGATTGGAAATGCTTTTGTTGAGCAGTATTACCATATTCTCCATCATTCCCCTGAGCTGGTTCACCGATTTTACCAAGATACAAGTATGTTGAGTCGACCGGATCTTAATGGTCTCATGACAACTGTGACAACCATGAAAAGCATAAATGACGAGATATGTAACTTGGACTATAAGAACTACAAGGCAGAGATCAAAACTGCTGATGCTCAGAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057768643.1
MEYNYIQRLESLFTLTWSLCVLVANSHSSLQNSLVISFSSYSFSPHSYLSFSTPQIKCLQSGMATQTESPPPAPSAQVIGNAFVEQYYHILHHSPELVHRFYQDTSMLSRPDLNGLMTTVTTMKSINDEICNLDYKNYKAEIKTADAQNSFKEGVIVLVTGCLTGKDNMRRKFTQTFFLAPQDKGYYVLNDVFRYVEESKSDVVSEVATVADDTPSSTLTQDPEPAQVIDPPKAENITHAEETKTFEEKENDQVIAERVA...

XP_057768644.1
MATQTESPPPAPSAQVIGNAFVEQYYHILHHSPELVHRFYQDTSMLSRPDLNGLMTTVTTMKSINDEICNLDYKNYKAEIKTADAQNSFKEGVIVLVTGCLTGKDNMRRKFTQTFFLAPQDKGYYVLNDVFRYVEESKSDVVSEVATVADDTPSSTLTQDPEPAQVIDPPKAENITHAEETKTFEEKENDQVIAERVASHPRDIVVEAESCSNENHASVAEEPITSASQEDAPKKSYASIVSSQTKKGPAKVYVPTTTRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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