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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001225`

染色体: Chr06 坐标: 12657750-12658484 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001225`
名称	SmilChr06G001225
描述	uncharacterized SmilChr06G001225
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12657750 - 12658484 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988742`
GeneID	`130988742`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988742`
原始查询	`SmilChr06G001225`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=41.5; qcov=0.776; evalue=2.24e-34; confidence=medium
Rice	`Os03g0643050` - identity=42.1; qcov=1.03; evalue=2.25e-52; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988742

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768669.1`
2	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057768669.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057768669.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768669.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768669.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12657791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	92	A13,A16,A20,A22,A25,A5,A8,A9,B1,B100,B103,B106,B112,B117,B118,B120,B124,B126,B128,B13,B134,B136,B138,B15,B16,B19,B24,B27,B33,B37,B45,B47,B49,B5,B50,B55,B57,B60,B61,B67,B7,B70,B72,B74,B79,B85,B88,B94,B95,B99,C12,C13,C16,C17,C19,C25,C26,C27,C30,C31,C35,C36,C37,C40,C41,C45,C5,C52,C53,C56,C58,C59,C60,C63,C64,C65,C66,C70,C73,C75,C77,C78,C79,C80,C81,C86,D1,D2,D4,D5,D6,D7
`Chr6:12657792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B93,C1,C17,C4,C49
`Chr6:12657804`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A9
`Chr6:12657804`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A9
`Chr6:12657825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C19
`Chr6:12657831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B105,B113,B132,B133,B31,B8,C3,C39,C7,C77
`Chr6:12657843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:12657860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C1,C17,C31,C4,C49
`Chr6:12657921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:12657950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:12657954`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B109,B114,B125,B38,B39,B48,B52,B70,B71,B77,B97,C20,C62,C63
`Chr6:12657968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B14,C73,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768669.1

196 aa

196

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

Plant_tran

PF13359 DDE_Tnp_4 1-134 aa PF01609 DDE_Tnp_1 4-131 aa PF04827 Plant_tran 79-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768669.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	1	134	1.2e-16	61.5	DDE superfamily endonuclease
`XP_057768669.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	4	131	2.8e-05	24.7	Transposase DDE domain
`XP_057768669.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	79	137	9.7e-05	22.8	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912686.1
TTAAGAAGGCCAGGTATAGAACACGTAAGGGCCAAATTGCGACCAACATGCTAGGAGTTTGTGATCGCAATATGAAGTTTGTATATGCATTGCCGGGTTGGAAGGGATCAGCGGCTGATTCTCACATACTCCGGGATGCAGTCAATAGGCCACATGGATTTAGAGTCCCCCGGGGGAATTATTATTTGGTAGATTGTGGATATGCAAACAGTGAAGACTTTCTTGCACCGTATAAAGAAGTTCGTTATCATTTGAAGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988742
ATGCTAGGAGTTTGTGATCGCAATATGAAGTTTGTATATGCATTGCCGGGTTGGAAGGGATCAGCGGCTGATTCTCACATACTCCGGGATGCAGTCAATAGGCCACATGGATTTAGAGTCCCCCGGGGGAATTATTATTTGGTAGATTGTGGATATGCAAACAGTGAAGACTTTCTTGCACCGTATAAAGAAGTTCGTTATCATTTGAAGGAGTGGGGGCCTACTAATGCAAGGCCTCAAAATACTGAGGAGTTGTTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768669.1
MLGVCDRNMKFVYALPGWKGSAADSHILRDAVNRPHGFRVPRGNYYLVDCGYANSEDFLAPYKEVRYHLKEWGPTNARPQNTEELFNLRHDKAQNVIELAFGILKMRWAALRSSTYYPIKIQIRLMMACVLLDNFIRSNMAIDPVEQQYDLLLQELEITNDEPKDFVDTINSSQAWNAEMDALAQTMWQQYCDAMN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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