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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001226`

染色体: Chr06 坐标: 12663134-12665459 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001226`
名称	SmilChr06G001226
描述	uncharacterized SmilChr06G001226
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12663134 - 12665459 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988744`
GeneID	`130988744`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988744`
原始查询	`SmilChr06G001226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein (DUF872) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822567]; symbol=AT3G29170; hit=AT3G29170; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	transmembrane protein (DUF872) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822567]; symbol=AT3G29170; hit=AT3G29170; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G29170` (AT3G29170) transmembrane protein (DUF872) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822567] identity=66.9; qcov=1.04; evalue=1.68e-41; confidence=medium
Rice	`Os12g0129000` - identity=68.4; qcov=1.01; evalue=3.66e-38; confidence=medium
GO	GO:0012505 (endomembrane system)
KEGG	-
Pfam	PF05915 (TMEM_230_134)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988744

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057768670.1`
2	Secretory vesicle	Secretory vesicle	1.00000	`XP_057768670.1`
3	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057768670.1`
4	Endosome	内体	1.00000	`XP_057768670.1`
5	Synaptic vesicle	Synaptic vesicle	0.80000	`XP_057768670.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12664708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768670.1

116 aa

116

TMEM_230_134

PF05915 TMEM_230_134 39-116 aa

XP_057768671.1

116 aa

116

TMEM_230_134

PF05915 TMEM_230_134 39-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768670.1`	Pfam	`PF05915`	TMEM_230_134	Family	39	116	2.4e-24	86.5	Transmembrane proteins 230/134
`XP_057768671.1`	Pfam	`PF05915`	TMEM_230_134	Family	39	116	2.4e-24	86.5	Transmembrane proteins 230/134

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912687.1
ACTCGGTAAACCCAATTTGATACTACTTGATCCAAAATTTATGTACGATTTGTCCGATTACATTTCTCTCTTATAATTTTGATCTAATCCTCCGCTGACGCAGCACCGGCGACTTTCATTTTCTCTCTCCTTCATCGCCGCTCTCTTCCACTACCTGCCGTTTCAGAAGACTGAGCTGCATTCACATCAGTTTCTCCGGTTCGCTGCTACTTTTCTACGGTTTTACTAATCGCCAGCTTCACGCCGCCGCTGCCGACTTT...

XM_057912688.1
TCCAAAATTTATGTACGATTTGTCCGATTACATTTCTCTCTTATAATTTTGATCTAATCCTCCGCTGACGCAGCACCGGCGACTTTCATTTTCTCTCTCCTTCATCGCCGCTCTCTTCCACTACCTGCCGTTTCAGAAGACTGAGCTGCATTCACATCAGTTTCTCCGGTTCGCTGCTACTTTTCTACGGTTTTACTAATCGCCAGCTTCACGCCGCCGCTGCCGACTTTTCCGCTCCTTGGTTTTCCAGGGATATTTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988744
ATGGCATCTAGACGGAATGTCCGTTATAGTCGTCTTGCTGATGACGACGATGATGATTATAATGGTCAAAATCGACATGACCCTAGATTTGATTATACTCCCAGAAGCTATGACAAAGTTCCTTGGAAGTCAATAATTCTCGCAATCTTTTTGCTCCTTCTTGGGTGTCTGCTTCTCTTGCTTGCAGTTTTCATCTTCACTGGTCACATGGGAGGGGAGCTCTCCCAAGCTTATGGCCTCTTAGGACTGGGTTTGCTTAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768670.1
MASRRNVRYSRLADDDDDDYNGQNRHDPRFDYTPRSYDKVPWKSIILAIFLLLLGCLLLLLAVFIFTGHMGGELSQAYGLLGLGLLTFVPGFYETRIAYYSWRGAQGYRFANIPDY

XP_057768671.1
MASRRNVRYSRLADDDDDDYNGQNRHDPRFDYTPRSYDKVPWKSIILAIFLLLLGCLLLLLAVFIFTGHMGGELSQAYGLLGLGLLTFVPGFYETRIAYYSWRGAQGYRFANIPDY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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