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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001233`

染色体: Chr06 坐标: 12719820-12725071 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001233`
名称	SmilChr06G001233
描述	probable WRKY transcription factor 4
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12719820 - 12725071 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988749`
GeneID	`130988749`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988749`
原始查询	`SmilChr06G001233`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 4
产物	probable WRKY transcription factor 4
Arabidopsis	`AT1G13960` (WRKY4) WRKY DNA-binding protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837956] identity=43.6; qcov=1.02; evalue=4.18e-98; confidence=medium
Rice	`Os12g0507300` (OsWRKY96) - identity=43; qcov=0.74; evalue=6.45e-67; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988749

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768676.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768676.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768676.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768676.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768676.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12722472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A3,B130,C61,C65
`Chr6:12722580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr6:12722620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr6:12722851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B77
`Chr6:12722919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A3,B130,C61,C65
`Chr6:12723100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr6:12724548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:12724590`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr6:12724590`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768676.1

516 aa

258

516

WRKY

PF03106 WRKY 234-290 aa PF03106 WRKY 406-463 aa

XP_057768677.1

427 aa

214

427

WRKY

PF03106 WRKY 234-290 aa PF03106 WRKY 406-426 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768676.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	234	290	4.6e-52	174.8	WRKY DNA -binding domain
`XP_057768676.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	406	463	4.6e-52	174.8	WRKY DNA -binding domain
`XP_057768677.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	234	290	4.4e-33	114.0	WRKY DNA -binding domain
`XP_057768677.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	406	426	4.4e-33	114.0	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912693.1
ACTTAAATAAATGCACTGTAAAACAATAAATATAATGTTTTTTTGAAAAAACAATAAATATTAGAAAAAAATCGGTTTTTTGAAAATTCAGATTACAGACATGGGGAGACGTAAGTCACTTTGATGACATAAATTCCGATTCCTTGTAGTAATAAAATTTGCATCATCCCAATCCAACAAAGTGGCGAAAATTCCACTATCTTTGCAGTGCAATTAACCTCGCAAAATTCGAAAAATTGTTTCTTTATTTTCGAATTGAA...

XM_057912694.1
TTTTTTGAAAAAACAATAAATATTAGAAAAAAATCGGTTTTTTGAAAATTCAGATTACAGACATGGGGAGACGTAAGTCACTTTGATGACATAAATTCCGATTCCTTGTAGTAATAAAATTTGCATCATCCCAATCCAACAAAGTGGCGAAAATTCCACTATCTTTGCAGTGCAATTAACCTCGCAAAATTCGAAAAATTGTTTCTTTATTTTCGAATTGAATTCTTTAATCTTTATCTTCTTGGAATTCTGTCCAGTAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988749
ATGGCTCAAACAGTGGGAGACGCGCAGCCGAGTTCGCGAGCCAAGCCGACGATACAGGTGCCGCCACGTGGCTCGGTGGGCTTCCTCTACGCAAACGGGTCGGGCCCTGGGTTCAGCCCGGGGCCGATGACCCTGGTGTCTAGCTTCTTCCCGGAGCAGAGCCCGTTCTCCTTCTCTCAGCTCTTGGCCGGAGCCATGGCGTCGCCGCTCGCCGCAAAGCCGGGGTTTCCCTCCGCCTATGATTCCTGGAAGGATGGGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768676.1
MAQTVGDAQPSSRAKPTIQVPPRGSVGFLYANGSGPGFSPGPMTLVSSFFPEQSPFSFSQLLAGAMASPLAAKPGFPSAYDSWKDGKEKSICDAGSNSEAGVGRKWDRPVNLVVPPPPQLQVESMGMSPLFMVPPGLSPSGLMSPLQSPFGMSHQQALAHVTAQAALSHSIMHMQEEFQHSSSAEAIVNHSSSAKTEALTQQKNPSPLHLENTKKELAEVSQSSKAAAGDKPANDGYNWRKYGQKHVKASECPRSYYKCT...

XP_057768677.1
MAQTVGDAQPSSRAKPTIQVPPRGSVGFLYANGSGPGFSPGPMTLVSSFFPEQSPFSFSQLLAGAMASPLAAKPGFPSAYDSWKDGKEKSICDAGSNSEAGVGRKWDRPVNLVVPPPPQLQVESMGMSPLFMVPPGLSPSGLMSPLQSPFGMSHQQALAHVTAQAALSHSIMHMQEEFQHSSSAEAIVNHSSSAKTEALTQQKNPSPLHLENTKKELAEVSQSSKAAAGDKPANDGYNWRKYGQKHVKASECPRSYYKCT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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