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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001234`

染色体: Chr06 坐标: 12738188-12739966 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001234`
名称	SmilChr06G001234
描述	uncharacterized SmilChr06G001234
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12738188 - 12739966 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990504`
GeneID	`130990504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990504`
原始查询	`SmilChr06G001234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=28.9; qcov=0.28; evalue=5.97e-22; confidence=weak
Rice	`Os09g0268800` - identity=23.1; qcov=0.343; evalue=6.94e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770716.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057770716.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057770716.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057770716.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770716.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12738208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B117
`Chr6:12738208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr6:12738214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr6:12738277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B77
`Chr6:12738278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C77
`Chr6:12738309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B74,B91,C86
`Chr6:12738328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B74,B91,C86
`Chr6:12738330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:12738336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr6:12738345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B67,C27,C9
`Chr6:12738362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B23,B55
`Chr6:12738371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770716.1

592 aa

296

592

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 270-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770716.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	270	299	3e-06	27.5	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914733.1
ATGTCTGCCTCGCCTCGAATCTCTCCGGCAGATAAGGGGGGGCTTAACCTCCCACCGGTGTCGAATAACTTTCAACCCTCGTCAGTTGCTACCGCTAGTGCTTCGTTAAGAAAGGAAACTACTGTTCCGAATTTGTCTTCGGAAACTACTGCGGCCGTTGACAAGACTACGACGCCTAAAGACTCCTATGCAAGGATCACGGCTCCACAACGTACCAAAAAACCTGATATCCCTGCGCATAAATTTCAGGCGCTCCGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990504
ATGTCTGCCTCGCCTCGAATCTCTCCGGCAGATAAGGGGGGGCTTAACCTCCCACCGGTGTCGAATAACTTTCAACCCTCGTCAGTTGCTACCGCTAGTGCTTCGTTAAGAAAGGAAACTACTGTTCCGAATTTGTCTTCGGAAACTACTGCGGCCGTTGACAAGACTACGACGCCTAAAGACTCCTATGCAAGGATCACGGCTCCACAACGTACCAAAAAACCTGATATCCCTGCGCATAAATTTCAGGCGCTCCGTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770716.1
MSASPRISPADKGGLNLPPVSNNFQPSSVATASASLRKETTVPNLSSETTAAVDKTTTPKDSYARITAPQRTKKPDIPAHKFQALRPINIGDNGVLKVPRDLQLFQANKFQHAIIGRLLLNKGEKPRTTRDLKSELQSLWAIKSPWFLMPMGKGYYTLKFTTPEDKATAKAHVIWDLKAGSIRLRDWVRYFNPYKESSSLAQVWVRIYELPVEFWHPEVLTGIGHWLGQPLKIDGNSLDDEVAHFARILVEIDLAKKLPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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