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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001238`

染色体: Chr06 坐标: 12766124-12818545 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001238`
名称	SmilChr06G001238
描述	cyclic dof factor 2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12766124 - 12818545 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988768`
GeneID	`130988768`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988768`
原始查询	`SmilChr06G001238`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclic dof factor 2-like
产物	cyclic dof factor 2-like
Arabidopsis	`AT5G39660` (CDF2) cycling DOF factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833962] identity=41.9; qcov=1.02; evalue=1.1e-106; confidence=medium
Rice	`Os07g0685000` (OsCDF3) - identity=41.2; qcov=0.858; evalue=2.14e-81; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02701 (Zn_ribbon_Dof)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988768

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768709.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057768709.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768709.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768709.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768709.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12815556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:12815842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:12815943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr6:12816352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C72
`Chr6:12818120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B41,B42,B43,C19
`Chr6:12818224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B37,B63,B95,C29
`Chr6:12818274`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B120,B14,B27
`Chr6:12818274`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B120,B14,B27
`Chr6:12818297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B41,B43,C19
`Chr6:12818319`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B120,B14
`Chr6:12818319`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B120,B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768709.1

515 aa

258

515

Zn_ribbon_Dof

PF02701 Zn_ribbon_Dof 152-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768709.1`	Pfam	`PF02701`	Zn_ribbon_Dof	Family	152	208	8.6e-33	113.0	Dof domain, zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090200.1
AGTATTCATTGATCAGAGAGAGAAAACACACACAAACACACACCAAAAAGGTGCTCCCAGAAATAGAAAAAAAGAACGCAAAAAAACGCAGTTACACGGTCAGTGTGAGTGCGTGTCAGATCTCCCAATTTTATCCCAACTCATCGGGAGTTCTTTTGTCTGGTTTATATACGGAAAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGGTGGAGGGGATAATGAGAGAGAAAATGTCTGAAGTGAAAGACCCCAAGATAAAGCTTTTCGG...

XR_009090197.1
AGTATTCATTGATCAGAGAGAGAAAACACACACAAACACACACCAAAAAGGTGCTCCCAGAAATAGAAAAAAAGAACGCAAAAAAACGCAGTTACACGGTCAGTGTGAGTGCGTGTCAGATCTCCCAATTTTATCCCAACTCATCGGGAGTTCTTTTGTCTGGTTTATATACGGAAAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGGTGGAGGGGATAATGAGAGAGAAAATGTCTGAAGTGAAAGACCCCAAGATAAAGCTTTTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988768
ATGAGAGAGAAAATGTCTGAAGTGAAAGACCCCAAGATAAAGCTTTTCGGCAAAACCATTGAACTGCCAGACACTGCCTCCGAGGCAGCGGTGGCGGCGGAGAAGGCTGGTGAAGCAGCTCAGTCATTTGATGCTGCCGGAGATGATGATTCGATTCAAGATCCCCCTTGTTCATCTAACTCGATGATTGAAGAAAACGATTTGAATGGCGACGCAGAGGACCAAGAATCGAACATGAACCAATCAGGTTTAAAACAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768709.1
MREKMSEVKDPKIKLFGKTIELPDTASEAAVAAEKAGEAAQSFDAAGDDDSIQDPPCSSNSMIEENDLNGDAEDQESNMNQSGLKQDNKEEDQAQPLTSDELKDPNTTPCIVADPKALSADSDAGPVQSSKMEEDQTETSNSQDKTLKKPDKILPCPRCNSMDTKFCYFNNYNVNQPRHFCKNCQRYWTAGGTMRNVPVGAGRRKNKNAASQFRHLTVPNVLQNARVDLQNGIHHPVLSPNGTVITFNSDTPLCESMVSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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