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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001244`

染色体: Chr06 坐标: 12845725-12847086 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001244`
名称	SmilChr06G001244
描述	uncharacterized protein At5g19025-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12845725 - 12847086 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988806`
GeneID	`130988806`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988806`
原始查询	`SmilChr06G001244`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820469]; symbol=AT3G01170; hit=AT3G01170; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820469]; symbol=AT3G01170; hit=AT3G01170; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G01170` (AT3G01170) Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820469] identity=50.6; qcov=1.04; evalue=4.12e-69; confidence=high
Rice	`Os05g0488500` - identity=41.6; qcov=0.826; evalue=9.49e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28125 (At5g19025_N); PF30682 (At5g19025_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988806

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057768754.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057768754.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057768754.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768754.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12846237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,B89,C10
`Chr6:12846255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr6:12846337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:12846348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr6:12846377`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C11,D8
`Chr6:12846377`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C11,D8
`Chr6:12846558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B77,C13
`Chr6:12846582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B77,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768754.1

224 aa

112

224

At5g19025_N

At5g19025_C

PF28125 At5g19025_N 56-127 aa PF30682 At5g19025_C 143-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768754.1`	Pfam	`PF28125`	At5g19025_N	Domain	56	127	1.8e-21	77.5	At5g19025 N-terminal domain
`XP_057768754.1`	Pfam	`PF30682`	At5g19025_C	Domain	143	212	5.9e-16	58.6	At5g19025 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912771.1
ATCCTAACATCATATAGTTGAAAGTCCAGTCCATCGTAGTCCACAAACTTCCAACGCGAAGAGTCTGTCATGTGTGTAATGTGTGCTAACATCTAAAGCCGAGCCACTCAATCTCATCTGACGACTGACGCAGCTTTACAAGGAAGGGATAACTTAACTGATAAAATCAAACCACCAGACAGCAGCCTCTGATATATGACTACTTACATATGACTCCACAAATTTGCTTTGTCCCCTCAAGCCGGCCAAGAACTATTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988806
ATGTTCTGTTTCCACAGCTCTATTCCGGTTGACCAGCACATAGAAATGGCGAAATCCGTGAATCCAAGCGACCCGTGTTCGAAGGCGAAGCAAAGCGATCAGTTCAGCAAGAACAGAAGGAACCCAAACCCCCCTCACCGCTGCGATCAATCCCGCTCCGCCTTGATCGATGTGGTGATCCTGATCGCCGTGGTCTGCGCCTGCGGATTCCTGCTGTATCCGTACGTGAAGATTCTAGGGCAGAAGGCCGCCGAGCTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768754.1
MFCFHSSIPVDQHIEMAKSVNPSDPCSKAKQSDQFSKNRRNPNPPHRCDQSRSALIDVVILIAVVCACGFLLYPYVKILGQKAAELSEEVAEVVIEEVVRAPLVFGCLGLSIVFAVTALVAITVCTDNRCGKSGCSGLRKAAEFDIQLETEDAVSKSNNLQRSAASYKKGLFELPRDHHRELEAELKKMAPPNGRAVLVFRARCGCSLGRMEVPGPRRSRKVRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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