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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001245`

染色体: Chr06 坐标: 12866229-12869707 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001245`
名称	SmilChr06G001245
描述	uncharacterized SmilChr06G001245
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12866229 - 12869707 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988765`
GeneID	`130988765`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988765`
原始查询	`SmilChr06G001245`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820400]; symbol=AT3G01175; hit=AT3G01175; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820400]; symbol=AT3G01175; hit=AT3G01175; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G01175` (AT3G01175) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820400] identity=27.8; qcov=1.13; evalue=1.15e-54; confidence=low
Rice	`Os09g0413600` (P0643D11.22-2) - identity=26.9; qcov=0.6; evalue=7.88e-27; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07891 (DUF1666)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988765

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	0.80000	`XP_057768704.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057768704.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057768704.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057768704.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768704.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12866970`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C48
`Chr6:12866970`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C48
`Chr6:12868124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr6:12868871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C1,C31,C57,C6,D9
`Chr6:12869095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B44,D5
`Chr6:12869142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B120,C31,C39
`Chr6:12869142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C31,C39
`Chr6:12869214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B40,B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768704.1

552 aa

276

552

DUF1666

PF07891 DUF1666 306-550 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768704.1`	Pfam	`PF07891`	DUF1666	Family	306	550	1.1e-63	215.9	Protein of unknown function (DUF1666)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912721.1
AATTTCCATGCGGCTACTAATTAAATTATGCAAGAATGAGACATTTTATTCCTCATTTTTGGCTCACTCTTTCAACCCAAAATAATATGAGAAGGAAATTTCGTGGATATGTAGAAAAATGTATTGCACTCCACCTATATTAATTAATCTTGTAATAATTTATGAGCAGTTGATTAGAAATGGCTCTGATAGCTTCCTGTTGGCTGCTTGTCGAATCTTTCGTCGTCCCACATGGATTTGTCAAGTGGTTTTTCTTGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988765
ATGGCTCTGATAGCTTCCTGTTGGCTGCTTGTCGAATCTTTCGTCGTCCCACATGGATTTGTCAAGTGGTTTTTCTTGAGTTTTTACATTCATCCATTCTTTCTTGTTTTCTGCCAACTCTTTCTATGGCTCAAGGAGTTAATCTGCTTCTTCTTCTATCCTTTAAAAATCGCGTTGCGCCTCACTCTGTTTGTGTTTGGTCTGATTGTGAGGCTAGTCTTGTTTTTGTTTTCCTACATTAGGCCAATCAAAGGTGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768704.1
MALIASCWLLVESFVVPHGFVKWFFLSFYIHPFFLVFCQLFLWLKELICFFFYPLKIALRLTLFVFGLIVRLVLFLFSYIRPIKGDLFYDALEPETEHIAVQDCQLFIGRSRFESIEEIVGDCCVKDSWLNQYLYSDHYNYTTSALIIYDVNMSESMEVHPDQHKRTTSSSPSTFVDQSVDDDDDLESSDETEDSVISPDSSASDPLMLENMLQDDSVSPISSLDSNDSSSAGVVLDDAEDPFHNKYTSRVRFFDVLYHE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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