当前解析结果
SmilChr06G001256| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001256 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001256 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001256 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 13067243 - 13067935 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990514 |
|---|---|
| GeneID | 130990514 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990514 |
| 原始查询 | SmilChr06G001256 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990514 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770725.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770725.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770725.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770725.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057770725.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:13067249 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:13067250 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B96 |
Chr6:13067293 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B3,C22,C54,D3 |
Chr6:13067306 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr6:13067357 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B105 |
Chr6:13067438 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr6:13067493 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C80 |
Chr6:13067523 |
G |
GGC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 6 | A5,B15,B58,B9,C48,C55 |
Chr6:13067554 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B127,B135,B138 |
Chr6:13067561 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B139,B16,B32,B96,C4 |
Chr6:13067578 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B89,C10 |
Chr6:13067584 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C7,C85,D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。