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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001281`

染色体: Chr06 坐标: 13398518-13399672 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001281`
名称	SmilChr06G001281
描述	uncharacterized SmilChr06G001281
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13398518 - 13399672 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990518`
GeneID	`130990518`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990518`
原始查询	`SmilChr06G001281`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0468250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os10g0468250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=33.6; qcov=1.03; evalue=7.13e-58; confidence=low
Rice	`Os10g0468250` - identity=41.5; qcov=1.02; evalue=1.49e-78; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990518

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770730.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057770730.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057770730.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770730.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13398525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr6:13398538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B18,B53,C15,C68
`Chr6:13398541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B18,B53,B61,C15
`Chr6:13398544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B18,B53,C15
`Chr6:13398548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B111,B19,B38,B59,B99,C42,C56
`Chr6:13398898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr6:13398919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr6:13398959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C11
`Chr6:13399070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C68
`Chr6:13399094`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B119,B121,B18,C17,C18,C60,D4
`Chr6:13399228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:13399250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C33,C56,C57,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770730.1

324 aa

162

324

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

Plant_tran

PF26138 DUF8040 1-70 aa PF01609 DDE_Tnp_1 96-262 aa PF13359 DDE_Tnp_4 102-263 aa PF04827 Plant_tran 207-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770730.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	1	70	4.9e-19	68.7	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057770730.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	96	262	2.3e-06	28.2	Transposase DDE domain
`XP_057770730.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	102	263	4.3e-21	75.9	DDE superfamily endonuclease
`XP_057770730.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	207	265	5.4e-05	23.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914747.1
ATGGACCGCAACACGTTCGGCCGGCTGTGTCAGGTGTTAAGGCAATTAGGAGGACTGAGTGATGGTAGACACGTAAGAGTAGAAGAGCAAGTAGCAATGTTCGTGTCTGTGCTTGCCCATCACAAAAAGAATAGGGTTATTGGCTTCGACTTTTGGAGATCCGGGCAGACTATTTCAAGGTATGTTCAAAAGGTCCTAACTGTATTATTGAGGCTTCACACGTTGCTATTGGTGAAACCTGAGGCTGTATCCGAGAACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990518
ATGGACCGCAACACGTTCGGCCGGCTGTGTCAGGTGTTAAGGCAATTAGGAGGACTGAGTGATGGTAGACACGTAAGAGTAGAAGAGCAAGTAGCAATGTTCGTGTCTGTGCTTGCCCATCACAAAAAGAATAGGGTTATTGGCTTCGACTTTTGGAGATCCGGGCAGACTATTTCAAGGTATGTTCAAAAGGTCCTAACTGTATTATTGAGGCTTCACACGTTGCTATTGGTGAAACCTGAGGCTGTATCCGAGAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770730.1
MDRNTFGRLCQVLRQLGGLSDGRHVRVEEQVAMFVSVLAHHKKNRVIGFDFWRSGQTISRYVQKVLTVLLRLHTLLLVKPEAVSENSTDPRWKWFEGCLGAVDGTYISVMVPNADKPRYRTRKGLILTNTLAACDRNLKFSYVLSGWEGFAADSRILRDAINRLHGLKVPKGNYYLCDNGYANSEGFLAPYKGVRYHLKEWGPTSARPQNAEELFNMRHTKARNCIERAFGIMKMRWGILQSNTFYPVKIQNRLIMACFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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