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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001290`

染色体: Chr06 坐标: 13473596-13474482 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001290`
名称	SmilChr06G001290
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13473596 - 13474482 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990522`
GeneID	`130990522`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990522`
原始查询	`SmilChr06G001290`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=52.2; qcov=0.312; evalue=7.24e-20; confidence=low
Rice	`Os02g0828533` - identity=43.8; qcov=0.637; evalue=2.26e-29; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990522

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770732.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770732.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770732.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770732.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13473781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C11
`Chr6:13473789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C72
`Chr6:13473796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B58,C11
`Chr6:13473813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:13473817`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A15,B111,B37,B41,B60,B80,C21,C27,C51,C7,C84
`Chr6:13473929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr6:13473948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:13473956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:13473973`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B44,C11,C9,D2,D4
`Chr6:13473973`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B44,C11,C9,D2,D4
`Chr6:13473976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C38
`Chr6:13474005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770732.1

215 aa

108

215

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 69-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770732.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	69	162	6.7e-29	100.2	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914749.1
ATGGATGAGTTGTTTGAGTTCTATAAGAAGCAGGTGAATCCCACTCATCCTCCACGAGTCACCTCATCTGCATCTCATTCACATGTCACTTCTAGTGCAAGCCATCGTCAACGACACCCTCGCTCTAAACGATCTCGAGGTTCTTGTGCTAGTTTAACACGACAGAGTGTTGAACAACAAGAAGAGGATGATATCTCAAAGTTGACAATTTATTTGTCAGAGAAGCAACACGTAGAGGATATTGGGCCAGAAAATGAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990522
ATGGATGAGTTGTTTGAGTTCTATAAGAAGCAGGTGAATCCCACTCATCCTCCACGAGTCACCTCATCTGCATCTCATTCACATGTCACTTCTAGTGCAAGCCATCGTCAACGACACCCTCGCTCTAAACGATCTCGAGGTTCTTGTGCTAGTTTAACACGACAGAGTGTTGAACAACAAGAAGAGGATGATATCTCAAAGTTGACAATTTATTTGTCAGAGAAGCAACACGTAGAGGATATTGGGCCAGAAAATGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770732.1
MDELFEFYKKQVNPTHPPRVTSSASHSHVTSSASHRQRHPRSKRSRGSCASLTRQSVEQQEEDDISKLTIYLSEKQHVEDIGPENEGDDDDGMDTFDILQWWQNNSVRYPILSVMARDILAIPISTVASKSAFSMGGRVLDQFRSSLSPKMVEALICSSDWLRSSSLFMNDEEDVSETEQENEFGMVMSSLGSREVNAAASAPVQSCTGPSSSRA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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