当前解析结果
SmilChr06G001291| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001291 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001291 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001291 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 13474572 - 13476361 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988812 |
|---|---|
| GeneID | 130988812 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988812 |
| 原始查询 | SmilChr06G001291 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988812 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057768761.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057768761.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768761.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768761.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057768761.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:13475405 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr6:13475435 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B128,B140,C11,C69 |
Chr6:13475488 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B44,C75 |
Chr6:13475504 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr6:13475533 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 32 | A19,A22,A3,B10,B102,B104,B12,B120,B133,B134,B21,B22,B41,B45,B52,B7,B81,B83,B84,B87,B95,B98,C12,C24,C27,C29,C30,C53,C54,C58,C59,C75 |
Chr6:13475536 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr6:13475549 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B128,B140,C11,C69 |
Chr6:13476011 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B128,C30,C32 |
Chr6:13476012 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr6:13476016 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B132 |
Chr6:13476017 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B112,B56,C68,C8 |
Chr6:13476020 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B133,B73 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。