当前解析结果
SmilChr06G001292| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001292 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001292 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001292 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 13476947 - 13477571 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990523 |
|---|---|
| GeneID | 130990523 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990523 |
| 原始查询 | SmilChr06G001292 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990523 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770734.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770734.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770734.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770734.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057770734.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:13476955 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,B8 |
Chr6:13476956 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 51 | A11,A14,A18,A9,B111,B114,B119,B122,B135,B14,B15,B19,B21,B24,B3,B40,B43,B47,B49,B5,B53,B56,B64,B66,B82,B86,B93,B96,B99,C10,C12,C13,C24,C27,C30,C32,C51,C53,C55,C60,C72,C73,C75,C8,C82,C83,C84,C85,D1,D10,D4 |
Chr6:13476958 |
TCA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B104,B63 |
Chr6:13476958 |
TCA |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B104,B63 |
Chr6:13477010 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr6:13477011 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 5 | B24,B36,B40,B82,C8 |
Chr6:13477011 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 5 | B24,B36,B40,B82,C8 |
Chr6:13477033 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,B94,C71 |
Chr6:13477051 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B83 |
Chr6:13477069 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 27 | A1,A25,A6,B102,B11,B112,B119,B121,B122,B131,B14,B23,B33,B36,B53,B56,B72,B73,B98,C14,C16,C37,C59,C73,C74,C77,D10 |
Chr6:13477073 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B83,B94,C37 |
Chr6:13477086 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B15,B37,B39 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。