当前解析结果
SmilChr06G001294| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001294 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001294 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001294 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 13481016 - 13482299 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988805 |
|---|---|
| GeneID | 130988805 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988805 |
| 原始查询 | SmilChr06G001294 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831931]; symbol=AT5G18130; hit=AT5G18130; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831931]; symbol=AT5G18130; hit=AT5G18130; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G18130 (AT5G18130)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831931] identity=31.6; qcov=1.35; evalue=3.1e-27; confidence=low |
| Rice | Os03g0806600- identity=36.1; qcov=0.517; evalue=1.28e-16; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF20705 (DUF6821) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988805 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057768753.1 |
| 2 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057768753.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057768753.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057768753.1 |
| 5 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057768753.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:13481517 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B24,B40,B82,C8 |
Chr6:13481531 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,B98 |
Chr6:13481838 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B52,B70,B71,C62 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057768753.1PF20705
DUF6821 75-104 aa
PF20705
DUF6821 106-207 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057768753.1 |
Pfam | PF20705 |
DUF6821 | Family | 75 | 104 | 2.6e-43 | 148.6 | Family of unknown function (DUF6821) |
XP_057768753.1 |
Pfam | PF20705 |
DUF6821 | Family | 106 | 207 | 2.6e-43 | 148.6 | Family of unknown function (DUF6821) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。