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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001298`

染色体: Chr06 坐标: 13521667-13523891 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001298`
名称	SmilChr06G001298
描述	serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13521667 - 13523891 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988803`
GeneID	`130988803`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988803`
原始查询	`SmilChr06G001298`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33
产物	serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33
Arabidopsis	`AT1G55310` (SCL33) SC35-like splicing factor 33 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841976] identity=66.2; qcov=1.01; evalue=6.08e-68; confidence=high
Rice	`Os07g0633200` (P0519E12.127) - identity=63.9; qcov=0.897; evalue=2.11e-62; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016607 (nuclear speck)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988803

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768749.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057768749.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057768749.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768749.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768749.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13522185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:13523092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:13523162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr6:13523379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B26,C48,C82,C85
`Chr6:13523392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B68,B69,B91,C61
`Chr6:13523603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,A18,C82,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768749.1

214 aa

107

214

RRM_1

PF00076 RRM_1 38-107 aa

XP_057768750.1

213 aa

106

213

RRM_1

PF00076 RRM_1 38-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768749.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	38	107	1.3e-18	67.4	RNA recognition motif
`XP_057768750.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	38	107	1.3e-18	67.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912766.1
CCCAATATTTAAAGCTATTATTAAGCCCAATCTAAAGAGAGGCGAAGAGAAGCTTCTCGAGAATCATCTTAAGCTTTATCTGCTATATAATCATTTGCTAAGACGGAGGAGAGAGAATTATTCAATCTTCAACTTGGGTGTCGTGCGATCGTCTCTCTGTGTGAACGAAAAATGGGTAGAAGATACAGCAGAAGTCCATCTCCTAGAGGTTATAGAAGGGGATACCGAAGCCCTAGCCCAAGGGGTCGTTACCGAAGCCG...

XM_057912767.1
CCCAATATTTAAAGCTATTATTAAGCCCAATCTAAAGAGAGGCGAAGAGAAGCTTCTCGAGAATCATCTTAAGCTTTATCTGCTATATAATCATTTGCTAAGACGGAGGAGAGAGAATTATTCAATCTTCAACTTGGGTGTCGTGCGATCGTCTCTCTGTGTGAACGAAAAATGGGTAGAAGATACAGCAGAAGTCCATCTCCTAGAGGTTATAGAAGGGGATACCGAAGCCCTAGCCCAAGGGGTCGTTACCGAAGCCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988803
ATGGGTAGAAGATACAGCAGAAGTCCATCTCCTAGAGGTTATAGAAGGGGATACCGAAGCCCTAGCCCAAGGGGTCGTTACCGAAGCCGTGCGAGAGACCTCCCAACTAGTCTGCTCGTTCGCAATCTTCGCCATGATTGCAGGCCTGAAGATCTCCGTGGCCCGTTTGGGGAATTTGGTCCGCTTAAGGACATTTACTTGCCACGCGATTATTACACAGGGCAGCCACGTGGCTTTGGTTTTGTGCAATATGTTGACCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768749.1
MGRRYSRSPSPRGYRRGYRSPSPRGRYRSRARDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGPFGEFGPLKDIYLPRDYYTGQPRGFGFVQYVDPDDAAEAKYHMDARVLLGRELTVVFAEENRKKPSEMRSRERISRRSSSRYSRSPRYGRSYSPSPRYRQTYSRSPSPGYYSPSPRGRYRSRSITPRGRERSYSRSPYRSRSRSRSPVRSRSRSWSPEGY

XP_057768750.1
MGRRYSRSPSPRGYRRGYRSPSPRGRYRSRARDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGPFGEFGPLKDIYLPRDYYTGQPRGFGFVQYVDPDDAAEAKYHMDARVLLGRELTVVFAEENRKKPSEMRSRERIRRSSSRYSRSPRYGRSYSPSPRYRQTYSRSPSPGYYSPSPRGRYRSRSITPRGRERSYSRSPYRSRSRSRSPVRSRSRSWSPEGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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