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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001307`

染色体: Chr06 坐标: 13582859-13586115 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001307`
名称	SmilChr06G001307
描述	histone-lysine N-methyltransferase ATXR4
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13582859 - 13586115 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988786`
GeneID	`130988786`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988786`
原始查询	`SmilChr06G001307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone-lysine N-methyltransferase ATXR4
产物	histone-lysine N-methyltransferase ATXR4
Arabidopsis	`AT5G06620` (SDG38) SET domain protein 38 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830550] identity=45.5; qcov=0.992; evalue=4.34e-103; confidence=high
Rice	`Os10g0410700` (OsSET38) - identity=48.5; qcov=0.86; evalue=7.4e-100; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0034968 (GO:0034968)
KEGG	-
Pfam	PF00856 (SET)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988786

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057768729.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057768729.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768729.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768729.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13583190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr6:13583232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr6:13583241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr6:13583277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:13583362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	80	A13,A14,A16,A24,A3,A5,A7,A9,B10,B105,B110,B111,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B133,B138,B18,B21,B23,B29,B31,B39,B4,B42,B43,B44,B47,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B58,B61,B64,B78,B8,B85,B87,B9,B90,B92,B94,B95,B98,C10,C11,C12,C15,C17,C25,C27,C28,C32,C33,C34,C4,C53,C54,C55,C56,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C70,C75,C76,C82,C84,D8
`Chr6:13583735`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	90	A14,A16,A19,A20,A24,A4,A7,A9,B100,B101,B102,B110,B112,B117,B119,B12,B121,B122,B128,B129,B13,B134,B135,B137,B138,B14,B140,B17,B18,B19,B21,B24,B27,B29,B3,B35,B37,B4,B42,B43,B46,B47,B51,B52,B54,B55,B58,B60,B62,B65,B71,B74,B75,B81,B85,B87,B9,B92,B95,C12,C15,C17,C22,C29,C3,C32,C34,C35,C39,C4,C42,C43,C5,C50,C51,C53,C54,C6,C60,C61,C64,C65,C68,C71,C74,C80,C84,C85,D4,D5
`Chr6:13583744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	84	A14,A16,A19,A20,A24,A7,A9,B100,B101,B110,B112,B117,B119,B12,B121,B128,B129,B130,B134,B135,B137,B138,B14,B17,B18,B19,B21,B27,B29,B3,B35,B37,B4,B42,B43,B45,B46,B47,B51,B52,B54,B55,B58,B59,B60,B62,B65,B74,B75,B81,B85,B87,B9,B92,B95,C12,C15,C17,C29,C3,C32,C34,C35,C39,C4,C42,C43,C5,C50,C53,C54,C6,C60,C61,C64,C65,C68,C71,C72,C74,C80,C84,C85,D5
`Chr6:13584590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr6:13584714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr6:13585700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768729.1

357 aa

178

357

SET

PF00856 SET 63-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768729.1`	Pfam	`PF00856`	SET	Family	63	326	1.3e-11	45.5	SET domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912746.1
CTTAGATGAGAACCACCGCCTAAGACCCGTCTAAGACACTATGCATTGAAGATGCTCTTATAAATAAGATACGAAGATTAAAGTGGTGCATAAATTTATCGAGCTTCAGTCTACACTAATAAATCGCAGCTGAGAAGAAAATGTCACGCTTATTCCGTTTCAGCCGTCAGGCTTTCGATCTCAAAACCCTCCACCGCCGTCGCGCCGGAACGCTGCCGTTCCCCTCATCCTTCTCCTCTTCCGCTACTGAATCGCCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988786
ATGTCACGCTTATTCCGTTTCAGCCGTCAGGCTTTCGATCTCAAAACCCTCCACCGCCGTCGCGCCGGAACGCTGCCGTTCCCCTCATCCTTCTCCTCTTCCGCTACTGAATCGCCCGCCGCCTCCGAACCGGAGCCGCCTCCTTACATTCCGCCTCCCGTCGGCCTCGCGCGCACCAAGCATGTCGGGCGCGCCTTGTTCGCGATTCAGCCTCTCGCCGCCGGCGAGCTCCTCCATATCGCCACACCTGTTATCCTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768729.1
MSRLFRFSRQAFDLKTLHRRRAGTLPFPSSFSSSATESPAASEPEPPPYIPPPVGLARTKHVGRALFAIQPLAAGELLHIATPVILHPSLSMINCVCYYCLRRLPKRDGTAEAPHTVSFCSQRCEQDSKKFYDVEKQVDWSRFHEYCRQQGLKYPLIVKRLACQIVAGKIPAGIFELLQREDLSDKTHLIKEEFSLLRSTLEDADIKVEKTKNETDEGKGPIVDGEAEPEEPLSFLTEEWYTDVLGRIRINAFRVELPVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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