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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001331`

染色体: Chr06 坐标: 13809811-13815756 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001331`
名称	SmilChr06G001331
描述	NDR1/HIN1-like protein 10
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13809811 - 13815756 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990531`
GeneID	`130990531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990531`
原始查询	`SmilChr06G001331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NDR1/HIN1-like protein 10
产物	NDR1/HIN1-like protein 10
Arabidopsis	`AT2G27260` (AT2G27260) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817268] identity=37.1; qcov=0.719; evalue=1.72e-36; confidence=medium
Rice	`Os07g0531500` (P0681F05.132) - identity=30.1; qcov=0.582; evalue=3.36e-19; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057770742.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057770742.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057770742.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770742.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770742.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13809844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C1
`Chr6:13809853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B28,C22,D3
`Chr6:13811071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B1
`Chr6:13811071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:13811076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C36
`Chr6:13811103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:13811111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B111,B3,C83
`Chr6:13811154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B48,C15
`Chr6:13811200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B85,C3
`Chr6:13811201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr6:13811236`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C75
`Chr6:13811236`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770742.1

285 aa

142

285

LEA_2

PF03168 LEA_2 141-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770742.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	141	237	3.3e-08	34.6	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914759.1
ATGGCTGATGGCCGGAGGTTCAAGTTTGATGAATTATTTTGGTGGGATACGACATCCACCAAAGTTGTTCGGGAAAATCATGTCCCGAAGAGTCCTGTTGGTGTTGTCATTCTCGTTGTTCAGTCGGACAAGTCGCTCGATCTCAGCGTTGAACAAAAGATCTTCGTTTCCTGCACTCATGTGGACTCCATCCCCAACCAGCAGCAGAACTACCAATACGACGCCAAGTCCGTCCGCCGCGCCACCTGCCTCCGCCGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990531
ATGGCTGATGGCCGGAGGTTCAAGTTTGATGAATTATTTTGGTGGGATACGACATCCACCAAAGTTGTTCGGGAAAATCATGTCCCGAAGAGTCCTGTTGGTGTTGTCATTCTCGTTGTTCAGTCGGACAAGTCGCTCGATCTCAGCGTTGAACAAAAGATCTTCGTTTCCTGCACTCATGTGGACTCCATCCCCAACCAGCAGCAGAACTACCAATACGACGCCAAGTCCGTCCGCCGCGCCACCTGCCTCCGCCGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770742.1
MADGRRFKFDELFWWDTTSTKVVRENHVPKSPVGVVILVVQSDKSLDLSVEQKIFVSCTHVDSIPNQQQNYQYDAKSVRRATCLRRIFAFVIGLIVIFGTATFIVWLILRPQLPEFRVDSLSISNFTLGNDLLISFTSEIKLTAKNPNKKMKLGYDHIETAIYYQSYSLSETTVAPFYQGTKNETSLTVRFAAAGSFLEKVAVDEITGERGKNDNVNFNLRMLSRVRFEAKVWRTRRRFLKVFCGDLVLGLPTSGRSEVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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