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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001333`

染色体: Chr06 坐标: 13865156-13866996 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001333`
名称	SmilChr06G001333
描述	uncharacterized SmilChr06G001333
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13865156 - 13866996 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988782`
GeneID	`130988782`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988782`
原始查询	`SmilChr06G001333`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724]; symbol=AT1G21280; hit=AT1G21280; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724]; symbol=AT1G21280; hit=AT1G21280; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G21280` (AT1G21280) Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724] identity=33.8; qcov=0.575; evalue=8.67e-40; confidence=low
Rice	`Os01g0909600` - identity=25.8; qcov=0.321; evalue=6.83e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14244 (Retrotran_gag_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988782

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768724.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057768724.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768724.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768724.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768724.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13865292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B112,B126,B23
`Chr6:13865455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:13865622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr6:13865630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C59
`Chr6:13865829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B140,B99,D11
`Chr6:13865990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C17
`Chr6:13865992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:13866092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B131,C85
`Chr6:13866190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr6:13866274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A25,B136,C60,D5
`Chr6:13866274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B136,C60,D5
`Chr6:13866725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768724.1

386 aa

193

386

Retrotran_gag_3

PF14244 Retrotran_gag_3 24-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768724.1`	Pfam	`PF14244`	Retrotran_gag_3	Domain	24	69	7.6e-18	64.8	Gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912741.1
TTTTTTATCAGAAGATAATGAGAGAAAAGTTTCTTTTCCACTTTTCGGTTCTAGCTTTTTCTTACTTTTCCAACATGGTATCCAGAGCATAAACCTTCCGCTGTTTTCCGATCTGTTTTCCGATGGCCCCTAAGCCGCAATTTCCTCCTGTTCCACCACATGAAGATCAGTCCAGCCCCTATTATTTGTCCAGCAGTGACAATCCTGGTGTGCAGCTGGTCACACAACAACTCAACGGATCCAATTATGTGAATTGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988782
ATGGCCCCTAAGCCGCAATTTCCTCCTGTTCCACCACATGAAGATCAGTCCAGCCCCTATTATTTGTCCAGCAGTGACAATCCTGGTGTGCAGCTGGTCACACAACAACTCAACGGATCCAATTATGTGAATTGGAATCGCTCCATGATGACGGCACTAATGGCGAAGAACAAACTTGCGTTTGTTGATGGTACCATCGATCGACCGCAACCGACTGAAGCGATCTATTCTCAGTGGCTCCGATGCAATAGCATGGTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768724.1
MAPKPQFPPVPPHEDQSSPYYLSSSDNPGVQLVTQQLNGSNYVNWNRSMMTALMAKNKLAFVDGTIDRPQPTEAIYSQWLRCNSMVVSWLRNSVVPDISSSLMYLDDASLIWNDLKDRFAQGNVARVYQLKQQLLTLKQGSDDVGAYYTKLRILWDEYKDFQPSRWCTCDTCRCHSSRKWCEFQMQECSMQFLIGLSSVYSQIRSQIISSLPFPSLSKIFALVLQEERQRSIDSVSTSAPPIISEMPGSIINAAGIGRGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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