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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001339`

染色体: Chr06 坐标: 13932978-13936487 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001339`
名称	SmilChr06G001339
描述	probable protein phosphatase 2C 43
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13932978 - 13936487 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988785`
GeneID	`130988785`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988785`
原始查询	`SmilChr06G001339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 43
产物	probable protein phosphatase 2C 43
Arabidopsis	`AT5G06750` (AT5G06750) Protein phosphatase 2C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830564] identity=64.4; qcov=1.02; evalue=1.25e-177; confidence=high
Rice	`Os02g0685600` (OsPP2C25) - identity=65.1; qcov=0.997; evalue=5.97e-178; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0043169 (cation binding)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C); PF13672 (PP2C_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988785

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057768727.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057768727.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057768727.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768727.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768727.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13934421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:13934585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr6:13934626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,D2
`Chr6:13935345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr6:13935420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr6:13935474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C14,C30,C40,C82,D6
`Chr6:13935588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C65
`Chr6:13935588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr6:13935889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B2,B93,C27
`Chr6:13936036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr6:13936118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B93
`Chr6:13936220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768727.1

379 aa

190

379

PP2C

PP2C_2

PF00481 PP2C 52-316 aa PF13672 PP2C_2 57-292 aa

XP_057768728.1

379 aa

190

379

PP2C

PP2C_2

PF00481 PP2C 52-316 aa PF13672 PP2C_2 57-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768727.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	52	316	7.4e-35	121.6	Protein phosphatase 2C
`XP_057768727.1`	Pfam	`PF13672`	PP2C_2	Family	57	292	9.8e-06	26.0	Protein phosphatase 2C
`XP_057768728.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	52	316	7.4e-35	121.6	Protein phosphatase 2C
`XP_057768728.1`	Pfam	`PF13672`	PP2C_2	Family	57	292	9.8e-06	26.0	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912745.1
AAGAAATTTTAAAAAAATATAGTTTCAGTTTTGTTTATTAAATTGAAAATTTTGCAACTTGCCGCACCCTTCGTCAACTTTTCCCCTCCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTCTCTCTCAGCTTTCGCTGCAAGTCCACATACTTTATTTCTCTCTCTACATCTATACGTACACGAGACCTATACATATATAAGCACACAGAATTATGATGCGAAATACCTGAAGCCCTTGTGCAATTTGAAATCCCAGATCCATCTTCT...

XM_057912744.1
TTGCCGCACCCTTCGTCAACTTTTCCCCTCCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTCTCTCTCAGCTTTCGCTGCAAGTCCACATACTTTATTTCTCTCTCTACATCTATACGTACACGAGACCTATACATATATAAGCACACAGAATTATGATGCGAAATACCTGAAGCCCTTGTGCAATTTGAAATCCCAGATCCATCTTCTCTCGCAGTTTCTCTTACAACTGCGAAAGTATCTTCCTTTTGCATAAAATTTGTTCAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988785
ATGTGCTCTTGGCTTGGAAGCTCGGTGTCCTCATGTTTGCGCCCTTTCAGTCGATATGCCCGTATGAACAGGGATGATGATGGCAGCGCGGGAGGTGAGGATGATGGGCTTCTATGGTCCAGAGACCTTGACAAGCATTCCCATGGCGAGTTTTCTTTTGCGATGGTCCAGGCGAACCAAGTCCTTGAGGATCAGAGCCAGGTCGAGACGGGCCGCCATGCCACCTTCGTTGGGGTCTATGACGGCCATGGTGGTTGTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768727.1
MCSWLGSSVSSCLRPFSRYARMNRDDDGSAGGEDDGLLWSRDLDKHSHGEFSFAMVQANQVLEDQSQVETGRHATFVGVYDGHGGCEAAKYISDHLFRHFLKLAKETGTISDEIIRSALSETENGFLTLVRRAYAVRPDIAAIGSCCLVGVIWKGTLYAANLGDSRAVIGYLDRPNKIVAEQLTGDHNASLEEVRRELKMSHPEDSQILVLKQGVWRIKGIIQVSRSIGDAYLKRPEFALDPTFPRFHLPEPLRRPVLRA...

XP_057768728.1
MCSWLGSSVSSCLRPFSRYARMNRDDDGSAGGEDDGLLWSRDLDKHSHGEFSFAMVQANQVLEDQSQVETGRHATFVGVYDGHGGCEAAKYISDHLFRHFLKLAKETGTISDEIIRSALSETENGFLTLVRRAYAVRPDIAAIGSCCLVGVIWKGTLYAANLGDSRAVIGYLDRPNKIVAEQLTGDHNASLEEVRRELKMSHPEDSQILVLKQGVWRIKGIIQVSRSIGDAYLKRPEFALDPTFPRFHLPEPLRRPVLRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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