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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001341`

染色体: Chr06 坐标: 13972490-13975342 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001341`
名称	SmilChr06G001341
描述	nudix hydrolase 23, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13972490 - 13975342 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988800`
GeneID	`130988800`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988800`
原始查询	`SmilChr06G001341`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 23, chloroplastic
产物	nudix hydrolase 23%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G42070` (NUDX23) nudix hydrolase homolog 23 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818807] identity=62.3; qcov=1.01; evalue=2.37e-127; confidence=high
Rice	`Os09g0553300` - identity=74.5; qcov=0.373; evalue=5.71e-59; confidence=low
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00740 (Riboflavin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00293 (NUDIX); PF14803 (Zn_ribbon_Nudix)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988800

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057768745.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057768745.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057768745.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768745.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768745.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13972931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B40,C8
`Chr6:13972954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,C13,C2,C32,C68
`Chr6:13973848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B62,C82
`Chr6:13974412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768745.1

296 aa

148

296

Zn_ribbon_Nudix

NUDIX

PF14803 Zn_ribbon_Nudix 102-135 aa PF00293 NUDIX 139-242 aa

XP_057768746.1

295 aa

148

295

Zn_ribbon_Nudix

NUDIX

PF14803 Zn_ribbon_Nudix 101-134 aa PF00293 NUDIX 138-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768745.1`	Pfam	`PF14803`	Zn_ribbon_Nudix	Domain	102	135	3.1e-13	50.1	Nudix N-terminal
`XP_057768745.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	139	242	4.5e-15	56.6	NUDIX domain
`XP_057768746.1`	Pfam	`PF14803`	Zn_ribbon_Nudix	Domain	101	134	3.1e-13	50.1	Nudix N-terminal
`XP_057768746.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	138	241	4.5e-15	56.6	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912763.1
TTCACACCGATATTTCACCAATGAAACACGCAGACACACACCCCCAATCTTCAAACTGGCCTATCGTTTTTACTCCCTCAATTATTAATTTTAAATTTGATTTATATTTTTCTCCATCATGATATTGGGAGATTTCCCACACCCAAAAAGATATCGCCTAAATTAATTGCAGCTACCACCAAAGGCTACTACAGCTGAAATTCGCAAGGTAGAAACAGAAACTAGAAAGTCAATTATAAATTGGAACTTCTATAATGCTC...

XM_057912762.1
AACACGCAGACACACACCCCCAATCTTCAAACTGGCCTATCGTTTTTACTCCCTCAATTATTAATTTTAAATTTGATTTATATTTTTCTCCATCATGATATTGGGAGATTTCCCACACCCAAAAAGATATCGCCTAAATTAATTGCAGCTACCACCAAAGGCTACTACAGCTGAAATTCGCAAGGTAGAAACAGAAACTAGAAAGTCAATTATAAATTGGAACTTCTATAATGCTCAAAACCATACAAATTCTTGGTTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988800
ATGCTCAAAACCATACAAATTCTTGGTTCTTCATCTTCTTCATCTGGGTATTTTTCCCTACCCCACAGATTAAAGAAGCCTTATTCAAATTTCCATTCAATTTCAAGAAACTCCATTTTAGCAGCGGTTTCAAAATCTCCAAAATCACATTTTTGTGCTTTCCAATTTCGAAAAGGTTGCACATTTAGAGCTTTTCAAATGTCGCACACCCATTCCGAGTCAACCCCAGATGGGGGACCATCACCCCCTTCGTCCTCAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768745.1
MLKTIQILGSSSSSSGYFSLPHRLKKPYSNFHSISRNSILAAVSKSPKSHFCAFQFRKGCTFRAFQMSHTHSESTPDGGPSPPSSSTSTAIYSAQGFTRKINFCQLCGGPTKHEVPDGEEKTRAICTRCGKIAYENPKMVVGCLIEHENKILLCKRNIQPSYGLWTLPAGYMEIGESAAEGAIRETWEEANAQVEILSPFAQLDIPLIGQTYVIFLAKLKRPDFSPGPESSECKLFALEDIPFDSLAFSSMLVTLNLYLE...

XP_057768746.1
MLKTIQILGSSSSSSGYFSLPHRLKKPYSNFHSISRNSILAAVSKSPKSHFCAFQFRKGCTFRAFQMSHTHSESTPDGGPSPPSSSTSTAIYSAGFTRKINFCQLCGGPTKHEVPDGEEKTRAICTRCGKIAYENPKMVVGCLIEHENKILLCKRNIQPSYGLWTLPAGYMEIGESAAEGAIRETWEEANAQVEILSPFAQLDIPLIGQTYVIFLAKLKRPDFSPGPESSECKLFALEDIPFDSLAFSSMLVTLNLYLED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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