当前解析结果
SmilChr06G001344| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001344 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001344 |
| 描述 | 11 kDa late embryogenesis abundant protein-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 14011856 - 14012600 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988840 |
|---|---|
| GeneID | 130988840 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988840 |
| 原始查询 | SmilChr06G001344 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 11 kDa late embryogenesis abundant protein-like |
| 产物 | 11 kDa late embryogenesis abundant protein-like |
| Arabidopsis | AT5G06760 (LEA4-5)Late Embryosis Abundant 4-5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830565] identity=60.3; qcov=0.708; evalue=2.11e-20; confidence=low |
| Rice | Os06g0324400 (OsLEA3)- identity=52.8; qcov=0.596; evalue=7.59e-08; confidence=low |
| GO | GO:0009793 (embryo development ending in seed dormancy) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03760 (LEA_1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988840 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057768773.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057768773.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057768773.1 |
| 4 | Mitochondrion intermembrane space | Mitochondrion intermembrane space | 0.20000 | XP_057768773.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768773.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057768773.1PF03760
LEA_1 3-66 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057768773.1 |
Pfam | PF03760 |
LEA_1 | Domain | 3 | 66 | 3.8e-20 | 72.9 | Late embryogenesis abundant (LEA) group 1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。