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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G001359

染色体: Chr06 坐标: 14149096-14151711 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G001359
名称SmilChr06G001359
描述cytosolic enolase 3-like
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向14149096 - 14151711 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130988851
GeneID130988851
locus_tag-
NCBI NameLOC130988851
原始查询SmilChr06G001359

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述cytosolic enolase 3-like
产物cytosolic enolase 3-like
ArabidopsisAT2G29560 (ENOC)
cytosolic enolase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817505]
identity=64.1; qcov=0.716; evalue=1.13e-28; confidence=medium
RiceOs06g0136600 (OsEno5)
-
identity=53.9; qcov=0.716; evalue=5.66e-25; confidence=medium
GOGO:0000015 (phosphopyruvate hydratase complex); GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004634 (phosphopyruvate hydratase activity); GO:0006096 (glycolytic process)
KEGG-
PfamPF00113 (Enolase_C); PF03952 (Enolase_N)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130988851

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytosol 细胞质基质 0.80000 XP_057768789.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.80000 XP_057768791.1
3 Nucleus 细胞核 0.80000 XP_057768792.1
4 Secreted 分泌到胞外 0.20000 XP_057768789.1
5 Peroxisome 过氧化物酶体 0.20000 XP_057768791.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr6:14150177 G GA 1bp_insertion frameshift_variant 1 B55
Chr6:14150177 G GA 1bp_insertion CDS_variant 1 B55
Chr6:14150179 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B55
Chr6:14150482 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D9
Chr6:14150500 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B51,C78
Chr6:14150520 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B119
Chr6:14151275 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C72
Chr6:14151280 C T EMS_canonical_SNV stop_gained 1 B4
Chr6:14151280 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B4
Chr6:14151506 C T EMS_canonical_SNV stop_gained 12 A16,B1,B10,B126,B133,B136,B27,B30,B64,B89,C65,C8
Chr6:14151508 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B102,C79
Chr6:14151518 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768789.1
167 aa
N
1
84
167
Enolase_N
Enolase_C
C
PF03952 Enolase_N 2-77 aa PF00113 Enolase_C 86-139 aa
XP_057768790.1
156 aa
N
1
78
156
Enolase_N
C
PF03952 Enolase_N 2-77 aa
XP_057768791.1
140 aa
N
1
70
140
Enolase_N
C
PF03952 Enolase_N 2-77 aa
XP_057768792.1
109 aa
N
1
54
109
Enolase_C
C
PF00113 Enolase_C 28-81 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057768789.1 Pfam PF03952 Enolase_N Domain 2 77 2.2e-26 93.3 Enolase, N-terminal domain
XP_057768789.1 Pfam PF00113 Enolase_C Domain 86 139 9.9e-15 55.3 Enolase, C-terminal TIM barrel domain
XP_057768790.1 Pfam PF03952 Enolase_N Domain 2 77 2e-26 93.4 Enolase, N-terminal domain
XP_057768791.1 Pfam PF03952 Enolase_N Domain 2 77 1.7e-26 93.6 Enolase, N-terminal domain
XP_057768792.1 Pfam PF00113 Enolase_C Domain 28 81 4.3e-15 56.5 Enolase, C-terminal TIM barrel domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA
XM_057912807.1
AAAAAAAAGAACAGATGTTCCTTGTCTTCGTCGTTTTTCCCCAAATGCCAACGAAAGCCCTCGTGGAGAATTCCCCAAATCTACAGTGAGAAAGCTTCCATCTTCGACGAGAATCTGCTATCCAATCCAAACCTCTGCGATTCGGCGCTGTCGCCGATGAGAAGCCGCAATTTTGTGCTGCCGATTTTGGTGTTAAATGGTTTATTTTTACTTCTCTTCATCTCATTCTTGTTTCTTTCTCTGCATTTTATACCATTTTC...
XM_057912808.1
AAAAAAGAACAGATGTTCCTTGTCTTCGTCGTTTTTCCCCAAATGCCAACGAAAGCCCTCGTGGAGAATTCCCCAAATCTACAGTGAGAAAGCTTCCATCTTCGACGAGAATCTGCTATCCAATCCAAACCTCTGCGATTCGGCGCTGTCGCCGATGAGAAGCCGCAATTTTGTGCTGCCGATTTTGGTGTTAAATGGTTTATTTTTACTTCTCTTCATCTCATTCTTGTTTCTTTCTCTGCATTTTATACCATTTTCAA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA
LOC130988851
ATGTATCTTGGTAATGGTGTATGTAGTGCTGGCAAGAATGTTAATGAGAAAATATCTGAAGCTTTAATTGGTATGGATCCAACTCTCCAAGTTCAAATTGATCAAGCCATGATAGACTTGGACAAGACAAATAAAAAGGGTGAACTTGGGGCAAATGCAATTCTAGCAGTCTCAATGGCTGCTTGCAGAGCAGGGGTAGCTGAAAAAGAGGTCCCATTATACAAACACATTGCCGATTTAGCTAGCAAAACAAGTTATCA...
LOC130988851
ATGTATCTTGGTAATGGTGTATGTAGTGCTGGCAAGAATGTTAATGAGAAAATATCTGAAGCTTTAATTGGTATGGATCCAACTCTCCAAGTTCAAATTGATCAAGCCATGATAGACTTGGACAAGACAAATAAAAAGGGTGAACTTGGGGCAAATGCAATTCTAGCAGTCTCAATGGCTGCTTGCAGAGCAGGGGTAGCTGAAAAAGAGGTCCCATTATACAAACACATTGCCGATTTAGCTAGCAAAACAAGTTATCA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA
XP_057768789.1
MYLGNGVCSAGKNVNEKISEALIGMDPTLQVQIDQAMIDLDKTNKKGELGANAILAVSMAACRAGVAEKEVPLYKHIADLASKTSYHLLVPAFTLTGGGNHAGNNLAIQEIMILRVGAKKFEKALQIGAETYHHLKVELRLGECIMRLEKQLAEERVARLEIELKTC
XP_057768790.1
MYLGNGVCSAGKNVNEKISEALIGMDPTLQVQIDQAMIDLDKTNKKGELGANAILAVSMAACRAGVAEKEVPLYKHIADLASKTSYHLLVPAFTLTGGGNHAGNNLAIQFEKALQIGAETYHHLKVELRLGECIMRLEKQLAEERVARLEIELKTC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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