当前解析结果
SmilChr06G001370| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001370 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001370 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001370 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 14366642 - 14369319 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988865 |
|---|---|
| GeneID | 130988865 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988865 |
| 原始查询 | SmilChr06G001370 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | alpha/beta hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820392]; symbol=AT3G12150; hit=AT3G12150; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | alpha/beta hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820392]; symbol=AT3G12150; hit=AT3G12150; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G12150 (AT3G12150)alpha/beta hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820392] identity=79.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os02g0195000- identity=73.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF09752 (ABHD18) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988865 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057768814.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.60000 | XP_057768814.1 |
| 3 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.60000 | XP_057768814.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057768814.1 |
| 5 | Lipid droplet | 脂滴 | 0.40000 | XP_057768814.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:14366930 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr6:14367150 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr6:14367216 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B120,D8 |
Chr6:14367330 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,D5 |
Chr6:14368648 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr6:14368944 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B128,B59,C70 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057768814.1PF09752
ABHD18 29-351 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057768814.1 |
Pfam | PF09752 |
ABHD18 | Family | 29 | 351 | 1.7e-125 | 419.5 | Alpha/beta hydrolase domain containing 18 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。