当前解析结果
SmilChr06G001371| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001371 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001371 |
| 描述 | protein POLYCHOME-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 14375962 - 14378093 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988866 |
|---|---|
| GeneID | 130988866 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988866 |
| 原始查询 | SmilChr06G001371 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein POLYCHOME-like |
| 产物 | protein POLYCHOME-like |
| Arabidopsis | AT2G42260 (UVI4)uv-b-insensitive 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818827] identity=42; qcov=1.04; evalue=5.62e-46; confidence=medium |
| Rice | Os04g0472700- identity=31.8; qcov=0.697; evalue=2.67e-12; confidence=low |
| GO | GO:0005634 (nucleus); GO:0051783 (regulation of nuclear division); GO:1904667 (negative regulation of ubiquitin protein ligase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988866 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057768815.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057768815.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057768815.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057768815.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768815.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:14376333 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B44 |
Chr6:14376333 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr6:14376337 |
CGG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B44 |
Chr6:14376337 |
CGG |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr6:14376546 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B111,B135,B70,C71 |
Chr6:14377144 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A16,B3,B70,B71,C62 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。