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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001372`

染色体: Chr06 坐标: 14381596-14383368 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001372`
名称	SmilChr06G001372
描述	uncharacterized SmilChr06G001372
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	14381596 - 14383368 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990535`
GeneID	`130990535`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990535`
原始查询	`SmilChr06G001372`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.7; qcov=1.04; evalue=3.59e-51; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=27.3; qcov=1.05; evalue=7.47e-60; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990535

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770745.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770745.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770745.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770745.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770745.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:14381602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A1,A4,A5,A8,B109,B11,B113,B134,B135,B24,B26,B29,B32,B40,B42,B43,B54,B55,B59,B61,B62,B87,C29,C3,C43,C47,C5,C55,C62,C78,C85,D7
`Chr6:14381622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B130,B30,D7
`Chr6:14381637`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A20,B102,B113,B115,B131,B133,B135,B18,B31,B36,B47,B68,B69,B7,B70,B77,B78,B90,B98,C10,C16,C25,C36,C37,C38,C41,C53,C6,C63,C79,C84,D11,D4,D5
`Chr6:14381641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	96	A13,A14,A19,A20,A21,A4,A6,A8,B1,B101,B105,B113,B115,B117,B12,B121,B125,B127,B129,B130,B131,B137,B140,B16,B17,B20,B21,B26,B3,B30,B32,B34,B38,B4,B40,B46,B47,B49,B50,B51,B53,B55,B56,B58,B59,B63,B64,B71,B72,B73,B78,B81,B86,B89,B97,C1,C10,C13,C14,C20,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C32,C35,C37,C4,C42,C46,C47,C5,C50,C59,C64,C65,C66,C7,C73,C74,C76,C81,C82,C87,C9,D10,D11,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr6:14381679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B39,D6
`Chr6:14381685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B30,D5
`Chr6:14381688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B30,B51
`Chr6:14381695`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B90
`Chr6:14381695`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B90
`Chr6:14381704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B5,C14
`Chr6:14381712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B14,B4,B41,C14
`Chr6:14381718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A19,B100,B110,B111,B119,B27,B39,B42,B45,B65,C40,C51,C85,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770745.1

538 aa

269

538

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 175-269 aa PF00872 Transposase_mut 192-345 aa PF04434 SWIM 420-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770745.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	175	269	5.4e-17	62.7	MULE transposase domain
`XP_057770745.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	192	345	5.3e-08	32.9	Transposase, Mutator family
`XP_057770745.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	420	450	1.1e-07	31.9	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914762.1
ATGAAGCAGGGCAAGGAATATTCTGTCACCAAATCAGACAGCAGACGAATTTACTTCAAATGCAAGCATTCAGATAAGTGCCCCTTCAAGCTCAGTGCATCGTCTCAAGATGGATCCATTTGGGGTGTGTATAAGTTTACCAATGAGCACTCATGCGACGGTGATCTAGGGCGCGTAAAGCGAATAAAGGCCCCCGCAAAAGTCGTTGCAACATATTTAACACAGAAAATAGATAACGATTGTGAGATCTTGAAGCCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990535
ATGAAGCAGGGCAAGGAATATTCTGTCACCAAATCAGACAGCAGACGAATTTACTTCAAATGCAAGCATTCAGATAAGTGCCCCTTCAAGCTCAGTGCATCGTCTCAAGATGGATCCATTTGGGGTGTGTATAAGTTTACCAATGAGCACTCATGCGACGGTGATCTAGGGCGCGTAAAGCGAATAAAGGCCCCCGCAAAAGTCGTTGCAACATATTTAACACAGAAAATAGATAACGATTGTGAGATCTTGAAGCCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770745.1
MKQGKEYSVTKSDSRRIYFKCKHSDKCPFKLSASSQDGSIWGVYKFTNEHSCDGDLGRVKRIKAPAKVVATYLTQKIDNDCEILKPKAIQLELQREFGVQIKYDVALRARNRATEMVYGRHDQSFEMLPKYLYMLRQSNPGSLVEWEVDPDGRFKHLFVALAALASCFIFNLRPVIVVDGTHLKGKNRGILFVAVTKDGNKSLFPLAYGVGPKENDESWMYFMSRIRRVYGQANPLLIVSDQYISIANAIRNELPNATHG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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