当前解析结果
SmilChr06G001384| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001384 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001384 |
| 描述 | probable plastid-lipid-associated protein 13, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 14484533 - 14486678 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990538 |
|---|---|
| GeneID | 130990538 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990538 |
| 原始查询 | SmilChr06G001384 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable plastid-lipid-associated protein 13, chloroplastic |
| 产物 | probable plastid-lipid-associated protein 13%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT2G42130 (AT2G42130)Plastid-lipid associated protein PAP / fibrillin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818813] identity=62.9; qcov=0.676; evalue=5.59e-62; confidence=high |
| Rice | Os04g0665800- identity=54; qcov=0.725; evalue=8.58e-53; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04755 (PAP_fibrillin) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990538 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.60000 | XP_057770747.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057770747.1 |
| 3 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057770747.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057770747.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770747.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057770747.1PF04755
PAP_fibrillin 77-188 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057770747.1 |
Pfam | PF04755 |
PAP_fibrillin | Family | 77 | 188 | 4.5e-05 | 24.2 | PAP_fibrillin |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。