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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001387`

染色体: Chr06 坐标: 14517698-14520503 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001387`
名称	SmilChr06G001387
描述	60S ribosomal protein L21-1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	14517698 - 14520503 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988880`
GeneID	`130988880`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988880`
原始查询	`SmilChr06G001387`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L21-1-like
产物	60S ribosomal protein L21-1-like
Arabidopsis	`AT1G09590` (AT1G09590) Translation protein SH3-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837486] identity=84.2; qcov=1; evalue=1.06e-101; confidence=high
Rice	`Os03g0141000` - identity=85; qcov=0.488; evalue=3.01e-47; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01157 (Ribosomal_L21e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988880

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768831.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057768831.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768831.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768831.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768831.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:14517844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr6:14517973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:14518036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B112,C42,C86,D3
`Chr6:14519819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:14519838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr6:14519841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B107,B2,B93,C48
`Chr6:14519887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768831.1

164 aa

164

Ribosomal_L21e

PF01157 Ribosomal_L21e 1-101 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768831.1`	Pfam	`PF01157`	Ribosomal_L21e	Family	1	101	3.2e-45	152.8	Ribosomal protein L21e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912848.1
AGCCATGAGCGGCCCATTCCCCTGAGAAAACCTTAAAACCCTAATTATTTTCCCAATATATATGATTCATCATCTTTCCCCAAAACCCTACACTCACATTCAGCTCAACCTATCAGAACAATGCCGGCTGGGCACGGACTGAGGTCGCGGACCAGAGATACGTTCTCGCGGCCTTTCAGAAAGAAGGGTCCGACCCATCTCTCCACCTACCTCCGCACCTACAAAACTGGAGACTATGTGGATGTCAAGGTTAACGGGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988880
ATGCCGGCTGGGCACGGACTGAGGTCGCGGACCAGAGATACGTTCTCGCGGCCTTTCAGAAAGAAGGGTCCGACCCATCTCTCCACCTACCTCCGCACCTACAAAACTGGAGACTATGTGGATGTCAAGGTTAACGGGTCGATCCACAAAGGCATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGAACGGGTCGGGTCTGGAACGTCACCAAGCGCGCCGTCGGCGTTGAAGTCAACAAGCAGGTGGGCAACAGAATTATAAGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768831.1
MPAGHGLRSRTRDTFSRPFRKKGPTHLSTYLRTYKTGDYVDVKVNGSIHKGMPHKFYHGRTGRVWNVTKRAVGVEVNKQVGNRIIRKRIHVHIEHVQQSRCHEEVMLRIKKNDQLKAEAKAQGKIISTKRQPEGPKPGFMVGGATLETVTPIPYDVVNDLKGGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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