当前解析结果
SmilChr06G001415| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001415 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001415 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001415 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 14855815 - 14859917 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988905 |
|---|---|
| GeneID | 130988905 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988905 |
| 原始查询 | SmilChr06G001415 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988905 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057768868.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057768868.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057768870.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768868.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768868.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:14856073 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B140 |
Chr6:14856112 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B140 |
Chr6:14856122 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B52,C10,C49,C73 |
Chr6:14856122 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B52,C10,C49,C73 |
Chr6:14856156 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B15,B61,B94,C45 |
Chr6:14856191 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C32 |
Chr6:14856228 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A16,B109,B111,B71,C83 |
Chr6:14856231 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr6:14856253 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | A18 |
Chr6:14856253 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr6:14856261 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,B140 |
Chr6:14856262 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 18 | A8,B103,B24,B25,B33,B49,B55,B79,B9,C13,C31,C4,C57,C58,C6,C78,D5,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。