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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001416`

染色体: Chr06 坐标: 14861866-14864032 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001416`
名称	SmilChr06G001416
描述	probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g66830
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	14861866 - 14864032 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988906`
GeneID	`130988906`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988906`
原始查询	`SmilChr06G001416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g66830
产物	probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g66830
Arabidopsis	`AT3G57830` (AT3G57830) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824952] identity=48.8; qcov=1.17; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0506400` (OsRLCK257) - identity=44.2; qcov=1.17; evalue=6.08e-151; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988906

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057768872.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768872.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768872.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768872.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768872.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:14862361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C19,D2
`Chr6:14862373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C37
`Chr6:14862942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:14863245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr6:14863589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B140
`Chr6:14863606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:14863657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,D11
`Chr6:14863756`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B55,C1
`Chr6:14863756`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B55,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768872.1

547 aa

274

547

LRRNT_2

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 23-64 aa PF00560 LRR_1 93-115 aa PF00560 LRR_1 117-139 aa PF00560 LRR_1 145-164 aa PF00069 Pkinase 339-449 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 339-451 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 451-533 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768872.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	23	64	4.7e-12	46.7	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057768872.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	93	115	1.4e-12	45.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057768872.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	117	139	1.4e-12	45.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057768872.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	145	164	1.4e-12	45.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057768872.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	339	449	7.6e-12	45.9	Protein kinase domain
`XP_057768872.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	339	451	4.7e-18	66.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057768872.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	451	533	4.7e-18	66.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912889.1
AATTCATTTTCTTTTTGTAATTTAAGTTGGATTTTTTACTTGGATTGGTCAACAAAAATTCAAATTCAGCATCTATATTGTATTGCCTCGAAAATCCATCGAAATCCCACTTCCTTCAATCCACACATCTTTCTCTTCTTCACATCTGCAGAAACATTTCTCGACAAGCATCCCATTTCTCCATCGCATGCATCAAAAAGATTGAATCTTTCACCATTGCACACAAAAAAGTTTGAATTTTGAAAAGAAGAAATGAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988906
ATGAACAAGTGCAGCATTGAAACATTCATTTGCTGCTTCACTCTCTGCATTCCTCTCACTTGTTCATTGAACTCGGACGCCCTCGCCCTCCTAGCACTGAAAGCCGCAATATCGGAAGACCCCGGAAACGCCGTCGTTTCATGGTCCTACTCCGATTCATCTCCATGCAAATGGGCTGGGATCATCTGCGACAGTGCTCACAATAGAGTCACCTCCATCTCACTCTCCGGAAAGAATCTGACGGGCTACGTTCCATCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768872.1
MNKCSIETFICCFTLCIPLTCSLNSDALALLALKAAISEDPGNAVVSWSYSDSSPCKWAGIICDSAHNRVTSISLSGKNLTGYVPSEIGALASLAFLDLSRNSFGGPLPHQIASLQSLVHLDISSNNFSGSLPQGLINLGNLRGTLNLSCNSFSGEIPASFGKLPMTVSLDLRRNNLSGEIPQVGSLLNQGPTAFSGNPFLCGFPTNTLCAEAETGNIPINPRKPEISSKNGEMKSGMVTVSVICGVSVAAMGMVFVSVW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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