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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001418`

染色体: Chr06 坐标: 14874177-14877383 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001418`
名称	SmilChr06G001418
描述	protein cornichon homolog 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	14874177 - 14877383 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988908`
GeneID	`130988908`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988908`
原始查询	`SmilChr06G001418`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein cornichon homolog 1-like
产物	protein cornichon homolog 1-like
Arabidopsis	`AT3G12180` (AT3G12180) Cornichon family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820395] identity=47.9; qcov=0.96; evalue=1.92e-45; confidence=medium
Rice	`Os12g0506400` (OsCNIH2) - identity=49.3; qcov=0.96; evalue=2.16e-39; confidence=medium
GO	GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF03311 (Cornichon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988908

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057768874.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057768874.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057768876.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768874.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768874.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:14877024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768874.1

157 aa

157

Cornichon

PF03311 Cornichon 6-123 aa

XP_057768876.1

150 aa

150

Cornichon

PF03311 Cornichon 6-123 aa

XP_057768877.1

150 aa

150

Cornichon

PF03311 Cornichon 6-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768874.1`	Pfam	`PF03311`	Cornichon	Family	6	123	9.8e-41	139.5	Cornichon protein
`XP_057768876.1`	Pfam	`PF03311`	Cornichon	Family	6	123	9.4e-41	139.6	Cornichon protein
`XP_057768877.1`	Pfam	`PF03311`	Cornichon	Family	6	123	9.4e-41	139.6	Cornichon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912894.1
AGTTCAATTTCAATATTAACTGGGTTACAATGGTTAAAAGTTTTTTGGGAGCTCTCACCTTTTGCCATTACTTTACAGGCTTCAGATCATGAAGTTACTCGTCGAGGAAATAGGATCCAAAAATCTTGCAGCGTCAGTAAATTCCAGTGTTAATTCCTTCGGGAAAAATTATGGATTGGTTACCTTTCCTCTGGCTAATTTTTTCATTCATGAACCTCACCCTATTGGGATTAAATTTTTACGAGTTCCTTGGTTTCTCG...

XM_057912893.1
GGGTTACAATGGTTAAAAGTTTTTTGGGAGCTCTCACCTTTTGCCATTACTTTACAGGCTTCAGATCATGAAGGCGTGTTACTGAACAATCATTATTTTATTTTATTCATTTTCCTTTTATTAATCCTCAGTTTTGTTTTTGAAATTTTTATTAATCCTCAGTTACTCGTCGAGGAAATAGGATCCAAAAATCTTGCAGCGTCAGTAAATTCCAGTGTTAATTCCTTCGGGAAAAATTATGGATTGGTTACCTTTCCTCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130988908
ATGGATTGGTTACCTTTCCTCTGGCTAATTTTTTCATTCATGAACCTCACCCTATTGGGATTAAATTTTTACGAGTTCCTTGGTTTCTCGGATTTGGAGGCTGACTATTTGAATCCCTATGAATTATCATCTCGTATCAACTATGTGATTGTGCCCGAGTATTTGTTGCATGGCGCATTGTGCGTTCTCTTTCTCATGACGGGTCATTGGATCATGTTCTTGCTCTCGCTGCCTACTGCATGCTATAATCTCAACCAGTA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057768874.1
MDWLPFLWLIFSFMNLTLLGLNFYEFLGFSDLEADYLNPYELSSRINYVIVPEYLLHGALCVLFLMTGHWIMFLLSLPTACYNLNQYLSNKHLVDVTEVFKVVNTEKKTRLIKLGFYVLFFGLVITRTIAMGAFSSVLSLLYSNDKEIDFRSQVLEF

XP_057768876.1
MDWLPFLWLIFSFMNLTLLGLNFYEFLGFSDLEADYLNPYELSSRINYVIVPEYLLHGALCVLFLMTGHWIMFLLSLPTACYNLNQYLSNKHLVDVTEVFKVVNTEKKTRLIKLGFYVLFFGLVITRLALSVVRAVFADDDDVVAWSTIY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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