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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001421`

染色体: Chr06 坐标: 14996192-15000071 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001421`
名称	SmilChr06G001421
描述	transcription factor bHLH48-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	14996192 - 15000071 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990109`
GeneID	`130990109`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990109`
原始查询	`SmilChr06G001421`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH48-like
产物	transcription factor bHLH48-like
Arabidopsis	`AT3G57800` (AT3G57800) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825530] identity=47.1; qcov=1.11; evalue=8.77e-82; confidence=high
Rice	`Os06g0613500` (OsbHLH095) - identity=53.9; qcov=0.519; evalue=2.33e-48; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990109

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770297.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770297.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770297.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770297.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770297.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:14996782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B4,B67,C11,C85
`Chr6:14996878`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A24,B10,B109,B11,B119,B131,B134,B33,B35,B83,C13,C17,C2,C20,C27,C3,C39,C41,C59,C63,C76,C81
`Chr6:14996960`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C20
`Chr6:14996960`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C20
`Chr6:14998902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B140
`Chr6:14999633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:14999645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:14999654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770297.1

343 aa

172

343

HLH

PF00010 HLH 189-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770297.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	189	236	8.4e-07	29.4	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914314.1
AATAAAAACTCCATCAAAGAGAGAGAGAAGAAAATTGAAAAAAAAAGGCAAATCCATTTTACACTCAACACGCACTGTAGAGAGAGAAAGTAAGCAGAGCTTTGCGCTTTGACCGCCACTGATATCGTAGCTCTCTCCTCTCAGAAGAAAAGGCGAAAAAAAGTAAAGGAAGAAACAGTGCGGCTGCCACAATCCTCGATTCCTTTCGCTGTCTATTTCGAATTGATGTGCCTTCACATTTTTCTTTTTTGCTAACACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990109
ATGGAGCCAAATGTTGAAGCGGTTCAACCGCAATTTAGATCCGGAATATCCGGAGCCAAACCAGGAGGAATGGGGTGCGTGTTCGGTGACATCCACGGCCTGATCCCCGGTCCACCGGAAACGGACGGCACATCTTTCACGGCGCTTCTGGAGCTCCCACCGCCGCAAGCTGTGGAGCTCTTGGTCAAGGAAGATTTTCCGGCGAAACCTATGCCGCCGCCAATTTTTCCTTCCAATATTGCCCTCATTGACCGCGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770297.1
MEPNVEAVQPQFRSGISGAKPGGMGCVFGDIHGLIPGPPETDGTSFTALLELPPPQAVELLVKEDFPAKPMPPPIFPSNIALIDRASMFSVFASADNPPESTNILSASSSMKIDSVKQEPLESENQRNSSSPAVSNQSLKSIKRKEREKKVKESSKKSKKVGANEASDGSGEQLPYVHVRARRGQATDSHSLAERARREKINARMKLLQDLVPGCNKISGTAMVLDEIINHVQALQRQVEFLSMRLAAVNPRIDFNLDAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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