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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001427`

染色体: Chr06 坐标: 15105919-15110179 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001427`
名称	SmilChr06G001427
描述	serine/threonine-protein kinase Nek6-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15105919 - 15110179 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990115`
GeneID	`130990115`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990115`
原始查询	`SmilChr06G001427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase Nek6-like
产物	serine/threonine-protein kinase Nek6-like
Arabidopsis	`AT3G20860` (NEK5) Serine/Threonine kinase catalytic domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821634] identity=70.8; qcov=0.508; evalue=3.7e-160; confidence=medium
Rice	`Os02g0590800` (OsNek6) - identity=68.8; qcov=0.503; evalue=1.11e-151; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990115

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770299.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770299.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057770299.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770299.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770299.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15106267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C5
`Chr6:15106371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C61
`Chr6:15106414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,D2
`Chr6:15106444`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B78,C35,C85
`Chr6:15106444`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B78,C35,C85
`Chr6:15106669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:15106942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:15107440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:15108753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,C79,D10
`Chr6:15108980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B9,C38
`Chr6:15109354`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr6:15109354`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770299.1

587 aa

294

587

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 15-269 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 17-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770299.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	15	269	2.1e-66	224.7	Protein kinase domain
`XP_057770299.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	17	266	6.1e-42	144.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914316.1
AAGAACGGTTGTGTGTGAAGGACTCCTCAAAAAGATTCAAGAAATCAATCATTATTAAATAAAGATTTCCATAAAGCTCGTAAAAAACAATCAAAACGATGAACTTTCATTATCGTTTTCAACGTTTCATTTGGTCATGTTAGTCTCTGCAGGTCTTAATTAGATCTATTGACTCCCAGCGCAATAAATTTCTATATTTCTCTAGCTTTTATGATCTCAACGAAATTTATTGTTAAATAATTGATTTTTTTAATTTATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990115
ATGGAGTCGGAGAACTGGGATTCCAAGTCGAAAATGGAGGATTATGAAGTAATCCAGCAGATTGGAAGAGGTGCTTTTGGAGCTACGTTTCTTGTGCTCCACAAAACTGAGAAGATCAGGTATGTGCTGAAGAAAATTCGAATTTCAAAGCAGACGGAGAAGTTCAAGCGTACGGCTCACCAAGAGATGAACTTAATCTCAAAACTACAGCATCCATATATCGTTGAATACAAGGATGCTTGGGTGGAGAAGGGAAGTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770299.1
MESENWDSKSKMEDYEVIQQIGRGAFGATFLVLHKTEKIRYVLKKIRISKQTEKFKRTAHQEMNLISKLQHPYIVEYKDAWVEKGSCICILTNYCEGGDMYEIIRRARGTYFSEEKICKWLTQLLLAIDYLHSNRVLHRDLKLSNIFLTKENDIRVGDFGLAKLLNEEEGLASSVVGTPNYMCPELLADIPYGYKSDIWSLGCCMFEIAAHHQAFKATDMAGLINKINRSLISPLPIIYSSTLKQIIKSMLRKSPEHRPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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