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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001436`

染色体: Chr06 坐标: 15169756-15172638 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001436`
名称	SmilChr06G001436
描述	uncharacterized SmilChr06G001436
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15169756 - 15172638 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990547`
GeneID	`130990547`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990547`
原始查询	`SmilChr06G001436`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0232800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os05g0232800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G17450` (AT3G17450) hAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821009] identity=35.5; qcov=0.287; evalue=1.1e-28; confidence=weak
Rice	`Os05g0232800` - identity=34.3; qcov=0.456; evalue=2.3e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990547

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770757.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770757.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770757.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770757.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770757.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15170150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr6:15170188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B30
`Chr6:15170189`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A19,B109
`Chr6:15170189`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A19,B109
`Chr6:15170220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:15170238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B120,B56,B96,C42
`Chr6:15170325`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	196	A1,A10,A11,A13,A15,A16,A19,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B14,B140,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B58,B59,B6,B60,B62,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B71,B73,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B85,B87,B88,B89,B9,B91,B95,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C82,C84,C87,C9,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr6:15170349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B65,C49
`Chr6:15170379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B133,B140,B19,C48
`Chr6:15170383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,D10
`Chr6:15170386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B30,B72,C8
`Chr6:15170411`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	195	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A22,A24,A25,A3,A5,A6,A7,A9,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B107,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B19,B2,B20,B23,B25,B27,B28,B3,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B49,B5,B51,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B98,C1,C10,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C4,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C85,C86,D1,D10,D11,D3,D4,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770757.1

588 aa

294

588

DUF8566

DUF659

PF29561 DUF8566 2-113 aa PF04937 DUF659 470-585 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770757.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	2	113	4.4e-17	63.3	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057770757.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	470	585	7.4e-38	130.2	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914774.1
TGCCTATGCAGTGTCATTTATTTGTGTTAGTGTCTTTTATATTGGTTAATAGTGTCATTTAAATGTCTATGCAGTGTCATTTATTTGTTATAGTAAATTATGGAATGTTTAATCGCAGACCCTTGAAAACAGAGGAAACTTATATTGTTAAGTGTAGAGGAGCTGATATTTGTGAATTAATACATGTGTTAAATGAAAGTCAGTGTCAAGCTGTAGTTGAATTAGGATTTGGGGGGATTTTAGAGATTAAAGACCCCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990547
ATGATCCCAAACAACGGGCCAGATGTTTTATTGAATTCAAAAGAGGACTCGGACATTTTTATAATGATCCACGAGTTCAAACAAAGATTTAGTTTAAAGGAATCTGGTACTCATGCACAGCTTTTAAAAATTATGAAGAATAATAATGCTTTGAAAGATGGAGATAATGATTTCAAAAGAATTTTCATCCTCTACATAATGTCAGCATTCCTAGCTTCTACAGCAAACCAAAGTGTTGATTTCAGTTTCTTCAAATCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770757.1
MIPNNGPDVLLNSKEDSDIFIMIHEFKQRFSLKESGTHAQLLKIMKNNNALKDGDNDFKRIFILYIMSAFLASTANQSVDFSFFKSLTNIERVKSFKWSKFVLERMCRGFDSSSSIKHWSAKRIKLRLEAENDAGDFGVGQWVEGVCPISNGIKETQTMEELVGQEAMVAKQEAVRGHETVSFPEEDYIDKESDGVRWIKYRLPDNEKTNLEIKNIAKDRFEELLMQFDRNMKIMGNQHINKLLDYKEQCVNHIKEREEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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