当前解析结果
SmilChr06G001437| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001437 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001437 |
| 描述 | protein MNN4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 15174390 - 15175735 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990126 |
|---|---|
| GeneID | 130990126 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990126 |
| 原始查询 | SmilChr06G001437 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein MNN4-like |
| 产物 | protein MNN4-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990126 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770311.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057770311.1 |
| 3 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.20000 | XP_057770311.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770311.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770311.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:15175251 |
TAA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A8,B33,B55,C13,C58,D5 |
Chr6:15175289 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B90,B92,C14,D10 |
Chr6:15175388 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 18 | A19,A9,B109,B13,B15,B27,B47,B57,B61,B85,B86,B94,C12,C13,C45,C59,C60,D1 |
Chr6:15175404 |
GAA |
* |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B25 |
Chr6:15175454 |
G |
GGT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 57 | A10,A14,A16,A19,A20,A5,A6,B107,B110,B112,B113,B114,B118,B132,B133,B139,B16,B19,B29,B32,B37,B38,B48,B50,B60,B61,B62,B63,B65,B67,B68,B75,B77,B8,B88,B97,B98,C12,C16,C20,C23,C24,C27,C28,C3,C39,C46,C47,C48,C56,C63,C7,C77,C79,C82,D4,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。