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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001448`

染色体: Chr06 坐标: 15293871-15295160 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001448`
名称	SmilChr06G001448
描述	uncharacterized SmilChr06G001448
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15293871 - 15295160 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990552`
GeneID	`130990552`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990552`
原始查询	`SmilChr06G001448`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=24.7; qcov=0.858; evalue=5.84e-13; confidence=weak
Rice	`Os02g0630250` - identity=30.6; qcov=0.382; evalue=1.97e-13; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990552

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770760.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770760.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057770760.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770760.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15293878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B27,C33
`Chr6:15293891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,C14,D10
`Chr6:15293982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,D10,D11
`Chr6:15293993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B30,C79,D10
`Chr6:15293994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C75,C86
`Chr6:15293995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C73
`Chr6:15294011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B138,B17,B29,B45,B6,C25,C29,C40,C55,D1
`Chr6:15294016`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A10,A13,A14,A20,A7,B1,B105,B112,B123,B139,B16,B18,B22,B26,B41,B43,B44,B46,B47,B64,B67,B78,B90,C18,C28,C41,C43,C49,C56,C6,C69,C79,C86,C87,D2,D5,D6
`Chr6:15294048`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	A10,A13,A14,A20,A7,B1,B101,B105,B112,B114,B123,B139,B16,B18,B22,B26,B37,B41,B43,B44,B46,B47,B64,B67,B71,B90,B91,C18,C28,C32,C41,C43,C49,C56,C6,C79,C80,C86,C87,D2,D3,D5,D6
`Chr6:15294067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B112,C31,C64
`Chr6:15294067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,C31,C64
`Chr6:15294084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A19,A2,A23,A7,B109,B111,B112,B123,B133,B140,B17,B19,B3,B35,B37,B42,B51,B55,B61,B70,B86,C16,C36,C47,C55,C64,C65,C75,C8,C82,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770760.1

325 aa

162

325

RVT_3

PF13456 RVT_3 172-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770760.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	172	292	8.1e-21	74.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914777.1
ATGGTTATAATGAATTATAGGGAATCATTTGTTTTAAGGTTGAAGGGTATATTGCTCGACGCACTCGACGTGCTCGTTGAAGAGACTGCCGAGCATATTTTCTGGCAATGCAGCAATATTCAGCCTATATGGCGGGAGTTCTTTCAGTGGTTTAAGTTCGATGATTTCTCTTACGATATACACAGTTTTTTTGTGGCTGCGTGGAACCGCGACACCAGCTCGCATGTGCGAACTTTTTGGAAAACTGGTATTATCACTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990552
ATGGTTATAATGAATTATAGGGAATCATTTGTTTTAAGGTTGAAGGGTATATTGCTCGACGCACTCGACGTGCTCGTTGAAGAGACTGCCGAGCATATTTTCTGGCAATGCAGCAATATTCAGCCTATATGGCGGGAGTTCTTTCAGTGGTTTAAGTTCGATGATTTCTCTTACGATATACACAGTTTTTTTGTGGCTGCGTGGAACCGCGACACCAGCTCGCATGTGCGAACTTTTTGGAAAACTGGTATTATCACTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770760.1
MVIMNYRESFVLRLKGILLDALDVLVEETAEHIFWQCSNIQPIWREFFQWFKFDDFSYDIHSFFVAAWNRDTSSHVRTFWKTGIITLIWAIWTLRNACIFKYKIFYAKHLLQIVRVAFKEVEGSFTKIGHMSNTWSDYLILRAIDVTTRAAPPPDMINVHWWPPVSHWIKVNTDGSASGAPGKIAAGGVFRDNVGWVRGCFHYKGGTGFAFEAELLAVIMAIQIAHSRGWFALWVESDSTYIVNLLNTRSNIVPWRFIAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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