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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001450`

染色体: Chr06 坐标: 15313273-15318796 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001450`
名称	SmilChr06G001450
描述	uncharacterized SmilChr06G001450
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15313273 - 15318796 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990137`
GeneID	`130990137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990137`
原始查询	`SmilChr06G001450`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990137

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770321.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770321.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770321.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770321.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770321.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15313394`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	C2,C32,C68
`Chr6:15313394`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr6:15313404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B12,B55
`Chr6:15313443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B3,C17,C36
`Chr6:15313456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A19,A24,A3,B102,B108,B132,B136,B22,B42,B43,B50,B57,B77,B87,B89,B93,B95,B98,C27,C28,C31,C34,C37,C53,C54,C6,C7,C72,C9,D2,D3
`Chr6:15313462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A18,B11,B29,B30,B45,B62
`Chr6:15313468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B10,B110,C20
`Chr6:15313468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B110,C20
`Chr6:15313471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B5,B97,C62,C78
`Chr6:15313472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B48,C50
`Chr6:15313485`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A16,B138,B18,B31,B95,C24,C61,C72
`Chr6:15313488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770321.1

348 aa

174

348

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 123-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770321.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	123	262	1.8e-13	51.6	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090842.1
GCCGGTGGGGGAGAGACGATTTTGTGTTAGACTTAGTTTGAATTTTATTGAACTATTTTTTATATTGTTGGTGAATGGTGATGAATTTGGGGATTTGGGAAATTTGAGAACTTAGTAGATTAAAATTGTTTGAACAATATTCAGGATGAATCTTAACCGGGAATGGATGTATACATGATATCGTGCTGATCGCAGTTTAAGTTTAGATTTTTTGGCTGGATTAGAATCGTTTATTGAATTTGCAACCAATCAGCCAAGAT...

XM_057914338.1
GGTGGGGGAGAGACGATTTTGTGTTAGACTTAGTTTGAATTTTATTGAACTATTTTTTATATTGTTGGTGAATGGTGATGAATTTGGGGATTTGGGAAATTTGAGAACTTAGTAGATTAAAATTGTTTGAACAATATTCAGGATGAATCTTAACCGGGAATGGATGTATACATGATATCGTGCTGATCGCAGTTTAAGTTTAGATTTTTTGGCTGGATTAGAATCGTTTATTGAATTTGCAACCAATCAGCCAAGATTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990137
ATGAGTGGAGGAGGGACTTCGTCATCACGAGTCTCGGCCAGTTCTTCAGGATCTGCAGCTGATGATGGTGGTCGTGTGGAGTTGACTTTCGGCGAGGGGGACTTTATGTATCCATATCATGCCGTTCCAACCACAATCACAAACAGTTTTAAAACCAACATGGATCATGATGGCTGGACATGGAGAGCAGTGCCGGATGCAACGAAACAGGATTACTGGGCTAAATTTAAGAAAGTGTATTGGTGGAAGGATGACCTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770321.1
MSGGGTSSSRVSASSSGSAADDGGRVELTFGEGDFMYPYHAVPTTITNSFKTNMDHDGWTWRAVPDATKQDYWAKFKKVYWWKDDLTDEAVYARWYARATVRYKDMIHKMKKGRPERPPWMRQNVWEKWLEYWNKDEVKAKAAKAQKNRMSEPDGPGTGISIHRGGSRNALQQHAVVLREQGVPAEEVDWSIFNVLHAKAGEFTYPRARDAYAQVTAKTAELAQSQLNDGSESQEVDMNRLLLDAVGGVSAKKRVFGIGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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