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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001454`

染色体: Chr06 坐标: 15390816-15393494 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001454`
名称	SmilChr06G001454
描述	MYB-like transcription factor ODO1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15390816 - 15393494 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990554`
GeneID	`130990554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990554`
原始查询	`SmilChr06G001454`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MYB-like transcription factor ODO1
产物	MYB-like transcription factor ODO1
Arabidopsis	`AT5G14340` (MYB40) myb domain protein 40 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831284] identity=70.2; qcov=0.283; evalue=1.8e-16; confidence=weak
Rice	`Os09g0401000` (OsMyb10) - identity=72.1; qcov=0.259; evalue=2.17e-16; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770761.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057770761.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770761.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770761.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770761.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15390837`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B120,B28,B78,C27,C52,C58,D9
`Chr6:15390842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr6:15390962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B65,C49
`Chr6:15391024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B115,B30,B31,C84
`Chr6:15391069`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B89,B99
`Chr6:15391069`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B89,B99
`Chr6:15391076`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B112
`Chr6:15391076`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B112
`Chr6:15391089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B35,B80,B98
`Chr6:15391137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C5
`Chr6:15391167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B65,C49
`Chr6:15391176`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B112,C11,C69,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770761.1

166 aa

166

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 40-63 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770761.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	40	63	7.3e-07	29.9	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914778.1
ATGGAAGAGGCGCCTGAAGATGAAGATGCCGAGAAATTCATTTCAATTGCTCAAACCCTAATCGACGTAATGATTGCAGGATTGCGGGATTTGTTAATTTGCCCCAATCTATACCTAAATCGGTGGTCTAAAACAGCGACACACTTTCCGGGAAGGACAGACAACGAGATCAAGAACTACTGGAACACGAGGATCAAGAAGAAGATGAAGCTCAAGGGATTGGACCTCGTCACCCACAAGCCGGTCCAGACGAAAACTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990554
ATGGAAGAGGCGCCTGAAGATGAAGATGCCGAGAAATTCATTTCAATTGCTCAAACCCTAATCGACGTAATGATTGCAGGATTGCGGGATTTGTTAATTTGCCCCAATCTATACCTAAATCGGTGGTCTAAAACAGCGACACACTTTCCGGGAAGGACAGACAACGAGATCAAGAACTACTGGAACACGAGGATCAAGAAGAAGATGAAGCTCAAGGGATTGGACCTCGTCACCCACAAGCCGGTCCAGACGAAAACTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770761.1
MEEAPEDEDAEKFISIAQTLIDVMIAGLRDLLICPNLYLNRWSKTATHFPGRTDNEIKNYWNTRIKKKMKLKGLDLVTHKPVQTKTRDFKTNNGEMQRHQNLGFQETTVSLIPNLKDYDDQMQHKTEEGSPSNQSRDDSCIKNSDMGSSLVFQNKESLGSFTMDSY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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