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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001474`

染色体: Chr06 坐标: 15645269-15649494 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001474`
名称	SmilChr06G001474
描述	short integuments 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15645269 - 15649494 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990159`
GeneID	`130990159`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990159`
原始查询	`SmilChr06G001474`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	short integuments 2, mitochondrial-like
产物	short integuments 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G41670` (AT2G41670) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818765] identity=64; qcov=1.08; evalue=4.25e-160; confidence=high
Rice	`Os11g0447300` (OsRALF-1) - identity=57.3; qcov=1.08; evalue=7.4e-140; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	-
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990159

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057770356.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057770356.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770356.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770356.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15645544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr6:15645553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr6:15645585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B124,B16,C22
`Chr6:15645726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B139,B82,C14
`Chr6:15646249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,D3
`Chr6:15646744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr6:15647198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:15647594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr6:15648726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B124,B16
`Chr6:15648744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B124,B16,B88,C22
`Chr6:15648760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B124,B16
`Chr6:15648772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B16,B6,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770356.1

377 aa

188

377

MMR_HSR1

PF01926 MMR_HSR1 137-240 aa

XP_057770357.1

351 aa

176

351

MMR_HSR1

PF01926 MMR_HSR1 111-214 aa

XP_057770358.1

342 aa

171

342

MMR_HSR1

PF01926 MMR_HSR1 102-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770356.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	137	240	3.7e-13	50.3	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057770357.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	111	214	3.1e-13	50.6	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057770358.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	102	205	2.9e-12	47.4	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914373.1
AGATATAGGTATATGTTGATCCGCGCTCATCTATCAGCGCTGCTGCGCTGCGCTCACAAAAGACTCCCTCCTCAATATATCAGGTACCGCCGCCATCTCTGAAACAACTCTTTCCTTTCTCTCTCCGTCTCTCGCCTCGCCGCCTCTCGCTTGCTTCCGGATTTGCCTACTGTCTCGCGTCACGCCTCTATGCTCTCTCTCTCTCGGCGCCGCCTCCGGTCAAGCCAGCACACAGCGGCGATTAGGTAGCTTAGGTTCAT...

XM_057914374.1
GTTGATCCGCGCTCATCTATCAGCGCTGCTGCGCTGCGCTCACAAAAGACTCCCTCCTCAATATATCAGGTACCGCCGCCATCTCTGAAACAACTCTTTCCTTTCTCTCTCCGTCTCTCGCCTCGCCGCCTCTCGCTTGCTTCCGGATTTGCCTACTGTCTCGCGTCACGCCTCTATGCTCTCTCTCTCTCGGCGCCGCCTCCGGTCAAGCCAGCACACAGCGGCGATTAGGTAGCTTAGGTTCATCTGTATCAATGTTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130990159
ATGGCGAGAAACATAGTGAAGAAAGCATCGTTAATCGGTGAAATGGGCTTCATCAAAGGCGGCGGCAAGATCAACTGGTTCCCCGGCCACATGGCTAGTGCCACTCGGGCCATCCGCGACCGCCTCAAACTCTCCGATTTCGTCATCGAAGTTCGGGACGCCCGTAAATGGATTGAGTACTTTGATTCAGTCAAACAAGATTGTTTAACGATAAATGCTCACAGCAGAAGTTCTGTTCAAAAGCTTCTAGACCTTGTTGA...

LOC130990159
ATGGCGAGAAACATAGTGAAGAAAGCATCGTTAATCGGTGAAATGGGCTTCATCAAAGGCGGCGGCAAGATCAACTGGTTCCCCGGCCACATGGCTAGTGCCACTCGGGCCATCCGCGACCGCCTCAAACTCTCCGATTTCGTCATCGAAGTTCGGGACGCCCGTATACCATTGTCATCTAAGAATGATGAACTGCAGCCTTTGCTGGAGGGTAAAAAGCGCGTCGTTGCTCTCAATAAGAAAGATTTGGCCAACCCCAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057770356.1
MARNIVKKASLIGEMGFIKGGGKINWFPGHMASATRAIRDRLKLSDFVIEVRDARIPLSSKNDELQPLLEGKKRVVALNKKDLANPNIMHKWIEYFDSVKQDCLTINAHSRSSVQKLLDLVEYKMKEAIRKEPTLLVLVVGVPNVGKSVLINSIHQIASSRFPVQGKRKRATVGPLPGVTQDIAGFKIAHQPSIYVLDTPGVLVPSIPDIETGLKLAAAGSVKDSVVGEERIAQYLLAVLNSRGTPLHWRRFMDVETDRR...

XP_057770357.1
MARNIVKKASLIGEMGFIKGGGKINWFPGHMASATRAIRDRLKLSDFVIEVRDARIPLSSKNDELQPLLEGKKRVVALNKKDLANPNIMHLLDLVEYKMKEAIRKEPTLLVLVVGVPNVGKSVLINSIHQIASSRFPVQGKRKRATVGPLPGVTQDIAGFKIAHQPSIYVLDTPGVLVPSIPDIETGLKLAAAGSVKDSVVGEERIAQYLLAVLNSRGTPLHWRRFMDVETDRRLDSEDKPDYSLPNLLPKRKTPPSIKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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