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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001478`

染色体: Chr06 坐标: 15739264-15743082 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001478`
名称	SmilChr06G001478
描述	transcription initiation factor IIB-2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15739264 - 15743082 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990163`
GeneID	`130990163`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990163`
原始查询	`SmilChr06G001478`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor IIB-2-like
产物	transcription initiation factor IIB-2-like
Arabidopsis	`AT3G10330` (AT3G10330) Cyclin-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820195] identity=74.1; qcov=1; evalue=1.82e-177; confidence=high
Rice	`Os09g0534800` (OsTFIIB) - identity=71.2; qcov=0.997; evalue=5.09e-172; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006352 (DNA-templated transcription initiation); GO:0017025 (TBP-class protein binding); GO:0070897 (transcription preinitiation complex assembly); GO:0097550 (transcription preinitiation complex)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00134 (Cyclin_N); PF00382 (TFIIB); PF08271 (Zn_Ribbon_TF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990163

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770361.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770361.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770361.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770361.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770361.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15739552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B34,C85,D10
`Chr6:15739794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr6:15741700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770361.1

313 aa

156

313

Zn_Ribbon_TF

TFIIB

Cyclin_N

TFIIB

PF08271 Zn_Ribbon_TF 6-48 aa PF00382 TFIIB 102-184 aa PF00134 Cyclin_N 113-197 aa PF00382 TFIIB 204-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770361.1`	Pfam	`PF08271`	Zn_Ribbon_TF	Domain	6	48	2.2e-15	56.6	TFIIB zinc-binding
`XP_057770361.1`	Pfam	`PF00382`	TFIIB	Domain	102	184	5.1e-33	113.7	Transcription factor TFIIB repeat
`XP_057770361.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	113	197	8.9e-06	26.2	Cyclin, N-terminal domain
`XP_057770361.1`	Pfam	`PF00382`	TFIIB	Domain	204	289	5.1e-33	113.7	Transcription factor TFIIB repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914378.1
CTCCATCACCGACCTCCGAAATCCCATGAATTGCCCCTTTCTCTGTCTATATATACCGCCTCTCCGATCCCCATCTCTCTCTATCTCATATTGTCTCCGAGCGCTTTAGAGAGAGAGATCGGGACCTTCGTATATCCACTCAGCCACACCAGTTCCGGCGAGATTTCCTATTGTTGACCTAATCGGAAGTTGGGAAAATTCAATTATTTGTATATATACATACACAATGATGTCCGACACATATTGTCCGGACTGCAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990163
ATGATGTCCGACACATATTGTCCGGACTGCAAGAGGAACACGGAGGTGGTGTGCGATCACGCGGCGGGCGACACCGTCTGCTCGGAGTGCGGCCTCGTGCTGGAAGCCCGCTCCATCGACGAGACGTCGGAGTGGCGGACGTTCGCCGATGATTCCGGCGACCACGACCCCAATCGTGTCGGAGGGCCCGTTAACCCGCTTCTGGGGGACGCGGCTCTGTCCACGGTCATCTCGCGGGCCGCCAATGGGTCGAATGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770361.1
MMSDTYCPDCKRNTEVVCDHAAGDTVCSECGLVLEARSIDETSEWRTFADDSGDHDPNRVGGPVNPLLGDAALSTVISRAANGSNVDTSLTRLQNRGGDPDRALVLAFKTISSMADRLSLVTTIKDRASEIYKRLEDQKCTRGRNLEALVAACIYIACRQEGKPRTVKEICSIVAGATKKEIGRAKEFIVKQLKVEMGESMEMGTIHAGDYLRRFCSNLGMSNEEVKAVQETVQKAGNFDIRRSPISIAAAIIFMITQLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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