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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001484`

染色体: Chr06 坐标: 15811774-15817228 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001484`
名称	SmilChr06G001484
描述	uncharacterized SmilChr06G001484
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15811774 - 15817228 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990565`
GeneID	`130990565`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990565`
原始查询	`SmilChr06G001484`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA-splicing endonuclease subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824903]; symbol=AT3G57360; hit=AT3G57360; species=arabidopsis; confidence=high
产物	tRNA-splicing endonuclease subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824903]; symbol=AT3G57360; hit=AT3G57360; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G57360` (AT3G57360) tRNA-splicing endonuclease subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824903] identity=51.8; qcov=0.628; evalue=3.26e-77; confidence=high
Rice	`Os09g0504800` - identity=45.7; qcov=0.595; evalue=2.41e-66; confidence=medium
GO	GO:0000214 (tRNA-intron endonuclease complex); GO:0000379 (tRNA-type intron splice site recognition and cleavage)
KEGG	-
Pfam	PF12928 (tRNA_int_end_N2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990565

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057770769.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057770769.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770769.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770769.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770769.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15812685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:15812815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr6:15812902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr6:15812992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B22,B36,B81,C79
`Chr6:15813598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C40
`Chr6:15813708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B96,C12
`Chr6:15813717`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A21,B107,B113,B127,B13,B44,B58,B66,B92,B96,B97,B99,C10,C12,C21,C29,C30,C43,C69,C78
`Chr6:15813844`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B111,B121,B125,B98,C60
`Chr6:15813844`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B111,B121,B125,B98,C60
`Chr6:15813853`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	B111,B121,B125,B129,B34,B52,B9,B98,C3,C38,C5,C60,C79
`Chr6:15813888`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B111,B121,B122,B125,B129,B24,B34,B98,C3,C38,C5,C60,C79
`Chr6:15816494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770769.1

390 aa

195

390

tRNA_int_end_N2

PF12928 tRNA_int_end_N2 168-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770769.1`	Pfam	`PF12928`	tRNA_int_end_N2	Domain	168	229	6e-16	59.0	tRNA-splicing endonuclease subunit sen54 N-term

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914786.1
ATGGAGTATATGTTGGACAGGATCTGGCTCGGAACCAAATTGGGTCGCGCCCTGGATCTGCGCTCATCGCTCACAAAAGAGACTCCCTATTCAATATATCGAGTATCGCCGCCGTCTCTGAAACAACTCTTTCCTTTCTCTCTCCGTCTCTCGCCTCGCCGCCTCTCACTTGCTTCCGATTTCGCCTACTGTCTCACGTCGCGCCTCTCCGCTCTCTCAACTCTCTCTCTCGGCGCCGCCTCCGGTCAAGCCAGCACACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990565
ATGGAGTATATGTTGGACAGGATCTGGCTCGGAACCAAATTGGGTCGCGCCCTGGATCTGCGCTCATCGCTCACAAAAGAGACTCCCTATTCAATATATCGAGTATCGCCGCCGTCTCTGAAACAACTCTTTCCTTTCTCTCTCCGTCTCTCGCCTCGCCGCCTCTCACTTGCTTCCGATTTCGCCTACTGTCTCACGTCGCGCCTCTCCGCTCTCTCAACTCTCTCTCTCGGCGCCGCCTCCGGTCAAGCCAGCACACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770769.1
MEYMLDRIWLGTKLGRALDLRSSLTKETPYSIYRVSPPSLKQLFPFSLRLSPRRLSLASDFAYCLTSRLSALSTLSLGAASGQASTQRQLGTLIPDSDRIEYHKFHGPTPSTVSCAAVGPCVPHRHRPDFATSSSLSSDDGAYDCDSDSEGFVGDSIDDELCFATGDIPKLQFRKERSKARWMEELGMAEVLEKKGKLWITTGIIRNGKTYCSIEETLYLAEIGALDILNVDDTPLPLSDMYTKLAEDKEKYGCSWESFE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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